Преобразование энергии в клетке. Общие вопросы и электронный транспорт

Стандартные свободные энергии химических реакций, их вычисление. Измерение стандартного окислительно-восстановительного потенциала. Структура отдельной митохондодрии. Энергии ковалентных связей. Первый этап разложения глюкозы в клетках - гликолиз.

Рубрика Биология и естествознание
Вид реферат
Язык русский
Дата добавления 06.09.2015
Размер файла 5,9 M

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

2) Туннельный, или подбарьерный перенос, описывается формулой Гамова с константой скорости k2:

,

где: k2 - число переходов в единицу времени [c -1];  - частота столкновений электрона с барьером. Ее можно оценить из частоты осцилляций электронов: ~1017 с-1; L - ширина барьера; me - масса электрона; U - высота барьера; а E1 - энергия электрона в первой яме.

Экспериментально обнаружено, что в ЦЭТ хлоропластов, устроенной аналогично ЦЭТ митохондрий, заметный перенос электронов между отдельными центрами-переносчиками происходит даже при 4о К, причем скорость переноса не зависит от температуры вплоть до 130о К. Даже при комнатной температуре вероятность туннельного переноса k2 на порядок превосходит вероятность надбарьерного переноса k1 (Рис.24). Это позволило предположить, что перенос электронов происходит главным образом путем туннелирования между донорно-акцепторными группами переносчиков, в которых электроны находятся в потенциальных ямах, разделенных сравнительно высокими и широкими потенциальными барьерами. Для такой системы выполняются условия квазиклассического приближения, когда барьер достаточно высок и его параметры мало зависят от наличия переносимого электрона. Считается, что правая и левая ямы не взаимодействуют, т.е. присутствие электрона в одной яме практически не влияет на состояние другого центра, т.е. на положение атомных ядер и на параметры барьера. И действительно, электронные (оптические) спектры поглощения молекул-переносчиков не изменяются при изменении редокс-состояния соседей. Поэтому можно считать, что в каждом центре электрон находится в самосогласованном поле ядер и других электронов и аппроксимировать такое поле потенциальным профилем, представленным на Рис. 25.

Размещено на http://www.allbest.ru

Размещено на http://www.allbest.ru

Рисунок 25 - Две несимметричные потенциальные ямы, разделенные потенциальным барьером

Физически донорно-акцепторные группы представляют собой атомы металлов с переменной валентностью (Fe2+  Fe3+) или коферменты, обладающие системой сопряженных связей, в которой делокализованы р-электроны. Они легко присоединяют и отдают электроны. Эти "проводящие" группы отделены друг от друга диэлектрическими молекулами белков и липидов, образующими потенциальные барьеры. В ЦЭТ переносчики плотно упакованы и мало подвижны друг относительно друга. В такой системе можно описывать волновой функцией только движение электрона, полагая, что ядра и остальные электроны создают потенциальный рельеф.

Для митохондриальной ЦЭТ можно следующим образом оценить величины, входящие в формулу Гамова. Ширина барьера L для переносчиков ЦЭТ примерно равна как двойному радиусу глобулы белка-переносчика - около 2 нм. Разницу (U-E1) можно оценить из спектров поглощения света молекулами переносчиков. Это величина порядка 1-2 eV.

Поведение электрона в системе из двух потенциальных ям зависит от разности электронных уровней в них: E=E1-E2 и от резонансного расщепления ДEr, возникающего при равенстве энергий E1=E2 за счет взаимодействия электронных уровней:

где: Е=Е12 - энергия резонанса при одинаковых уровнях в потенциальных ямах 1 и 2. При E >>Er переход не происходит. Условие туннелирования: E ? 0,1  0,06 eV. При E < Er возникают квантово-механические осцилляции электрона между ямами с периодом Tr=4рh/Er. Электрон будет с одинаковой вероятностью переходить слева направо и наоборот. Электронная плотность будет в среднем равномерно распределена между ямами, т.е. электрон будет делокализован. Направленное движение электрона осуществляется, если электроны будут все время поступать в левую яму, а из правой - уходить.

На некоторых участках ЦЭТ разность электронных уровней переносчиков меньше 0,1 eV, но на других, особенно тех, где осуществляется сопряжение переноса электронов с переносом протонов, E > 0,5 eV; это следует из измерений окислительно-восстановительных потенциалов, которые всегда соответствуют равновесным конформациям. В этом случае, казалось бы, туннелирование электронов маловероятно. Но сближение уровней возможно в результате релаксационных конформационных перестроек.

Как осуществляется сближение уровней Е1 и Е2 в реальных системах? Его могло бы обеспечить возбуждение колебательных подуровней, т.е. некоторая диссипация энергии, обеспечивающая подгонку электронных уровней и компенсацию энергетического дисбаланса. Колебания атомов в сложных молекулах образуют почти сплошной спектр. Так, у бензола плотность колебательных подуровней 104 1/eV, а у белков еще больше. Но перенос электрона в белках способен возбудить не любые колебательные степени свободы, а только "сильно сопряженные" с перемещением заряда. Лишь некоторые группы в молекулах белков-переносчиков способны перемещаться под влиянием движущегося электрона. То есть в данном случае колебательный спектр дискретен. Иными словами, при переносе электрона возбуждаются электроно-конформационные переходы в белковой части молекул между дискретными пространственно-энергетическими состояниями, и именно они способствуют сближению энергетических уровней электрона в обеих ямах с точностью до 0,1 eV.

Туннелирование электронов на расстояния 1-2 нм происходит за короткое время порядка 10-7 -10-6 сек, а конформационные переходы в молекуле белка - за 10-3-10-1сек. Именно медленные релаксационные конформационные превращения левого белка-переносчика после прихода на него электрона обеспечивают подгонку уровней в этой яме к уровням в правой яме, куда надлежит перенести электрон. Для туннелирования требуется не столько совпадение электронных уровней донора и акцептора в равновесных конформациях, сколько наличие виртуального электронного уровня донора электронов в восстановленной конформации (с электроном), равного одному из равновесных уровней акцептора в окисленном состоянии (без электрона). Когда электрон поступает на донор в левой яме, вследствие электроно-конформационного взаимодействия левый белок начинает претерпевать конформационные превращения, при которых смещаются все электронные уровни в левой яме. Когда в ходе этого конформационного превращения эти уровни совпадут с уровнями акцептора электронов в правой яме, произойдет туннелирование электрона. При этом энергия, выделяющаяся в ходе медленного конформационного превращения, может быть использована для выполнения полезной работы по переносу протонов и, в дальнейшем, по синтезу ATP. После ухода электрона левый белок начинает релаксировать в исходное состояние, а правый, в свою очередь, претерпевать конформационные переходы. Эти процессы приводят к рассогласованию уровней, и обратное туннелирование электронов оказывается невозможным. Зато при этом могут совпасть электронные уровни во второй и третьей ямах, и электрон будет туннелироваться дальше по цепи.

Следует отметить, что перенос электронов происходит не по прямой между донором и акцептором, а вдоль более сложного пути - "электронной тропы", на которой потенциальный барьер ниже, отклонению электрона с "тропы" препятствует резкое повышение потенциального барьера, как на трассе бобслея. Участками "электронных троп" могут быть -спиральные участки, ароматические группы с сопряженными связями и делокализацией электронов.

Кинетическая схема переноса электронов в ЦЭТ с указанием времени полуокисления (в мс):

750 800 80 5 2,5 0,5 0,4

NADH > ФМН > b > c1 > c > a > a3 > O2

показывает ускорение электронного потока по мере приближения к конечному звену, особенно после цитохрома с1. Если в клетках достаточно кислорода, то все цитохромы почти все время находятся в окисленном состоянии (без электронов).

В стационарном состоянии скорость потока электронов в ЦЭТ митохондрий 10-100 электронов в секунду.

Рекомендуемая литература

1. Скулачев В.П. Энергетика биологических мембран. М. Наука, 1989.

2. Албертс Б. и др. Молекулярная биология клетки. 2 изд. М. Мир, 1994.

3. Самойлов В.О. Медицинская биофизика. Санкт-Петербург, Спецлит, 2004.

4. Рубин А.Б. Биофизика, т. 2. М., Изд. МГУ, 2000, 2004.

5. Alberts B. et al. Molecular Cell Biology. 4-th edition. Garland Science. New York, 2002.

6. Nelson D. L., Cox M. M. Lehninger Principles of Biochemistry, Fourth Edition, W.H. Freeman & Company; 2005.

7. Berg J. M., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemistry, Fifth Edition. W.H. Freeman & Company; 2002.

Размещено на Allbest.ru


Подобные документы

  • Метаболизм (обмен веществ и энергии) как совокупность химических реакций, протекающих в клетках и в целостном организме, заключающихся в синтезе сложных молекул и новой протоплазмы (анаболизм) и в распаде молекул с освобождением энергии (катаболизм).

    реферат [221,8 K], добавлен 27.01.2010

  • Биологическое значение нуклеиновых кислот. Строение ДНК, взгляд на нее с химической точки зрения. Обмен веществ и энергии в клетке. Совокупность реакций расщепления, пластический и энергетический обмены (реакции ассимиляции и диссимиляции) в клетке.

    реферат [31,6 K], добавлен 07.10.2009

  • Современные представления о структуре организации электрон-транспортной цепи митохондрий и молекулярные преобразователи в клетках. Роль нарушений энергетики в развитии патологии. Основные молекулярные механизмы потребления энергии живой клеткой.

    контрольная работа [678,7 K], добавлен 23.02.2014

  • Обмен веществ и энергии как совокупность физических, химических и физиологических процессов превращения веществ и энергии в организме человека. Знакомство с основными составляющими рационального питания: энергетический баланс, сбалансированность.

    презентация [463,5 K], добавлен 13.02.2015

  • История открытия закона сохранения и превращения энергии. Фундаментальные законы природы. Закон сохранения и превращения энергии. Количественное соотношение теплоты и механической работы, механический эквивалент тепла. Смысл закона сохранения энергии.

    контрольная работа [44,0 K], добавлен 03.10.2011

  • Потоки вещества, энергии и деструкционные блоки в экосистемах. Проблемы биологической продуктивности. Пирамиды чисел, биомасс и энергии. Процессы трансформации вещества и энергии между биотой и физической средой. Биохимический круговорот веществ.

    реферат [52,1 K], добавлен 26.06.2010

  • Сущность понятия "биоэнергетика". Существенные признаки живого. Внешний и промежуточный обмен веществ и энергии. Метаболизм: понятие, функции. Три стадии катаболических превращений основных питательных веществ в клетке. Отличия катаболизма от анаболизма.

    презентация [3,9 M], добавлен 05.01.2014

  • Законы сохранения массы и энергии в макроскопических процессах. Самоорганизация химических систем и энергетика химических процессов. Особенности биологического уровня организации материи. Загрязнение окружающей среды: атмосфера, вода, почва, пища.

    контрольная работа [35,7 K], добавлен 11.11.2010

  • Энергетическая ценность продукта, методика расчета энергии. Составление энергетического баланса. Объективная и субъективная оценка состояния организма. Влияние дефицита получаемой энергии за сутки на снижение веса студента. Расчет энергетического баланса.

    курсовая работа [14,1 M], добавлен 10.04.2023

  • Понятие обмена веществ, анаболизма и катаболизма. Виды обменных процессов в теле человека. Потребность организма в витаминах и пищевых волокнах. Обмен энергии в состоянии покоя и при условии мышечной работы. Регуляция обменных процессов веществ и энергии.

    презентация [18,7 K], добавлен 05.03.2015

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.