Мониторинг внутриклеточного протеасомо-опосредованного гидролиза белков в физиологических условиях с применением ДНК-кодируемой резоруфин-лигазы

Протеасомо-опосредованный гидролиз белков. Функции и синтез липоевой кислоты в Escherichia coli. Использование LplA-лигазы в биохимических исследованиях. Методы работы с бактериями Escherichia coli. Денатурирующий электрофорез в полиакриламидном геле.

Рубрика Биология и естествознание
Вид курсовая работа
Язык русский
Дата добавления 23.01.2018
Размер файла 1,1 M

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

25. Elsasser, S., Chandler-Militello, D., Muller, B., Hanna, J., Finley, D. Rad23 and Rpn10 serve as alternative ubiquitin receptors for the proteasome (2004) J. Biol. Chem., 279.

26. Elsasser, S., Finley, D. Delivery of ubiquitinated substrates to protein-unfolding machines (2005) Nat. Cell B iol., 7.

27. Verma, R., Oania, R., Graumann, J., Deshaies, R.J. Multiubiquitin chain receptors define a layer of substrate selectivity in the ubiquitin-proteasome system (2004) Cell, 118.

28. Husnjak, K., Elsasser, S., Zhang, N., Chen, X., Randles, L., Shi, Y., Hofmann, K., Walters, K.J., Finley, D., Dikic, I. Proteasome subunit Rpn13 is a novel ubiquitin receptor (2008) Nature, 453.

29. Koegl, M., Hoppe, T., Schlenker, S., Ulrich, H.D., Mayer, T.U., Jentsch, S. A novel ubiquitination factor, E4, is involved in multiubiquitin chain assembly. (1999) Cell, 96.

30. Cadwell, K., Coscoy, L. Ubiquitination on nonlysine residues by a viral E3 ubiquitin ligase (2005) Science, 309.

31. Thrower, J.S., Hoffman, L., Rechsteiner, M., Pickart, C.M. Recognition of the polyubiquitin proteolytic signal (2000) EMBO J., 19.

32. D'Andrea, A., Pellman, D. Deubiquitinating enzymes: a new class of biological regulators (1998) Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol., 33.

33. Ha, B.H., Kim, E.E. Structures of proteases for ubiqutin and ubiquitin-like modifiers (2008) BMB Rep, 41.

34. Ciechanover, A. (2015) The unravelling of the ubiquitin system. Nat Rev Mol Cell Biol 16.

35. Ulrich, T. U., Wurtele, E. S., and Nikolau, B. J. (1990) Sequence of EMB-1, an mRNA accumulating specifically in embryos of carrot. Nucleic Acids Res 18.

36. Martin, S. J., Lennon, S. V., Bonham, A. M., and Cotter, T. G. (1990) Induction of apoptosis (programmed cell death) in human leukemic HL-60 cells by inhibition of RNA or protein synthesis. J Immunol 145.

37. Ong, S. E., Blagoev, B., Kratchmarova, I., Kristensen, D. B., Steen, H., Pandey, A., and Mann, M. (2002) Stable isotope labeling by amino acids in cell culture, SILAC, as a simple and accurate approach to expression proteomics. Mol Cell Proteomics 1.

38. Yen, H. C., Xu, Q., Chou, D. M., Zhao, Z., and Elledge, S. J. (2008) Global protein stability profiling in mammalian cells. Science 322.

39. Zhang, L., Gurskaya, N. G., Merzlyak, E. M., Staroverov, D. B., Mudrik, N. N., Samarkina, O. N., Vinokurov, L. M., Lukyanov, S., and Lukyanov, K. A. (2007) Method for real-time monitoring of protein degradation at the single cell level. Biotechniques 42, 446, 448, 450.

40. Eden, E., Geva-Zatorsky, N., Issaeva, I., Cohen, A., Dekel, E., Danon, T., Cohen, L., Mayo, A., and Alon, U. (2011) Proteome half-life dynamics in living human cells. Science 331.

41. Terskikh, A., Fradkov, A., Ermakova, G., Zaraisky, A., Tan, P., Kajava, A. V., Zhao, X., Lukyanov, S., Matz, M., Kim, S., Weissman, I., and Siebert, P. (2000) "Fluorescent timer": protein that changes color with time. Science 290.

42. Hinkson, I. V., and Elias, J. E. (2011) The dynamic state of protein turnover: It's about time. Trends Cell Biol 21.

43. Uttamapinant, C., White, K. A., Baruah, H., Thompson, S., Fernandez-Suarez, M., Puthenveetil, S., and Ting, A. Y. (2010) A fluorophore ligase for site-specific protein labeling inside living cells. Proc Natl Acad Sci U S A 107.

44. Cohen, J. D., Thompson, S., and Ting, A. Y. (2011) Structure-guided engineering of a Pacific Blue fluorophore ligase for specific protein imaging in living cells. Biochemistry 50.

45. Los, G. V., Encell, L. P., McDougall, M. G., Hartzell, D. D., Karassina, N., Zimprich, C., Wood, M. G., Learish, R., Ohana, R. F., Urh, M., Simpson, D., Mendez, J., Zimmerman, K., Otto, P., Vidugiris, G., Zhu, J., Darzins, A., Klaubert, D. H., Bulleit, R. F., and Wood, K. V. (2008) HaloTag: a novel protein labeling technology for cell imaging and protein analysis. ACS Chem Biol 3.

46. Keppler, A., Gendreizig, S., Gronemeyer, T., Pick, H., Vogel, H., and Johnsson, K. (2003) A general method for the covalent labeling of fusion proteins with small molecules in vivo. Nat Biotechnol 21.

47. Jing, C., and Cornish, V. W. (2013) A fluorogenic TMP-tag for high signal-to- background intracellular live cell imaging. ACS Chem Biol 8.

48. Reed, K.E. and Cronan, J.E., Jr. (1993) Lipoic acid metabolism in Escherichia coli:sequencing and functional characterization of the lipA and lipB genes. J. Bacteriol.

49. Reed, L.J., Leach, F.R. and Koike, M. (1958) Studies on a lipoic acid-activating system. J. Biol. Chem.

50. Koike, M. and Reed, L.J. (1960) Alpha-keto acid dehydrogenation complexes. II.The role of protein-bound lipoic acid and flavin adenine dinucleotide. J. Biol.Chem.

51. Cronan JE, Zhao X, Jiang Y (2005) Function, attachment and synthesis of lipoic acid in Escherichia coli. Adv Microb Physiol.

52. Fernandes-Suarez M, et al (2007) Redirecting lipoic acid ligase for cell surface protein labeling with small-molecule probes. Nat Biotechnol.

53. Cohen JD, Thompson S, Ting AY (2011) Structure-Guided Engineering of a Pacific Blue Fluorophore Ligase for Specific Protein Imaging in Living Cells. Biochemistry.

54. Daniel S. Liua, Lucas G. Nivуnb, Florian Richterb,c,1, Peter J. Goldmana, Thomas J. Deerinckd, Jennifer Z. Yaoa, Douglas Richardsone, William S. Phippsa, Anne Z. Yea, Mark H. Ellismand,f, Catherine L. Drennana,g,h, David Bakerb,i, and Alice Y. Tinga,(2014) Computational design of a red fluorophore ligase for site- specific protein labeling in living cells. Proc Natl Acad Sci USA.

55. UttamapinantС, et al (2010) A fluorophore ligase for site-specific protein labeling inside living cells. Proc Natl Acad Sci USA.

56. Hsieh, Y. C., Tedeschi, P., Adebisi Lawal, R., Banerjee, D., Scotto, K., Kerrigan, J. E., Lee, K. C., Johnson-Farley, N., Bertino, J. R., and Abali, E. E. (2013) Enhanced degradation of dihydrofolate reductase through inhibition of NAD kinase by nicotinamide analogs. Mol Pharmacol 83.

Размещено на Allbest.ru


Подобные документы

  • Электрофорез как один из наиболее важных методов для разделения и анализа компонентов веществ в химии, биохимии и молекулярной биологии. Электрофорез белков в полиакриламидном и агарозном геле. Оборудование для проведения капиллярного электрофореза.

    реферат [25,5 K], добавлен 31.08.2014

  • Структура мембранных белков. Очистка интегральных мембранных белков и получение их в биохимически активной форме. Необходимость поддержания концентрации детергента. Электрофорез в полиакриламидном геле. Связывание детергентов с мембранными белками.

    реферат [635,6 K], добавлен 03.08.2009

  • Физические и химические свойства, цветные реакции белков. Состав и строение, функции белков в клетке. Уровни структуры белков. Гидролиз белков, их транспортная и защитная роль. Белок как строительный материал клетки, его энергетическая ценность.

    реферат [271,2 K], добавлен 18.06.2010

  • Общее описание кишечной палочки, ее морфологические, культуральные, биохимические свойства, антигенная структура, токсинообразование. Оценка резистентности и патогенности. Лабораторная диагностика заболеваний, принципы их лечения и профилактика.

    курсовая работа [219,1 K], добавлен 24.09.2014

  • Физические, биологические и химические свойства белков. Синтез и анализ белков. Определение первичной, вторичной, третичной и четвертичной структуры белков. Денатурация, выделение и очистка белков. Использование белков в промышленности и медицине.

    реферат [296,5 K], добавлен 10.06.2015

  • Физические методы исследования строения белков. Зависимость биологической активности белков от их первичной структуры. Уравнение реакции переаминирования гистидина и глиоксиловой кислоты. Биологически активные производные гормона адреналина, их биосинтез.

    контрольная работа [172,9 K], добавлен 10.07.2011

  • Разрушение клеток и экстракция, разделение белков путем осаждения. Буферные растворы и специальные добавки, применение детергентов. Принципы хроматографии, классификация методов. Иммунный электрофорез, методы меченых атомов, иммуноферментный анализ.

    лекция [1,9 M], добавлен 18.10.2009

  • Изучение кодирования аминокислотной последовательности белков и описание процесса синтеза белка в рибосомах. Генетический код и синтез рибонуклеиновой кислоты. Построение цепи матричной РНК и синтез протеина. Трансляция, сворачивание и транспорт белков.

    реферат [3,5 M], добавлен 11.07.2015

  • Радиационные изменения, происходящие под влиянием облучения по существу во всех тканях. Нарушение внутриклеточного обмена белков, жиров и углеводов. Изменение обмена воды и солей. Нарушение внутриклеточного энергетического баланса, его последствия.

    контрольная работа [20,2 K], добавлен 08.07.2015

  • Электрофоретическая подвижность белка, влияющие факторов и условия электрофореза. Сущность метода полного разделения сложной смеси белков. Извлечение белков из геля после электрофореза. Гели агарозы и их применения. Влияние вторичной структуры ДНК.

    реферат [37,9 K], добавлен 11.12.2009

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.