Изучение генетического разнообразия диплостом (Trematoda: Diplostomidae) – паразитов рыб и птиц
Особенности систематики и биологии трематод рода Diplostomum. Главные проблемы идентификации и таксономии диплостом. Геномная вариабельность рДНК трематод. Анализ филогенетических связей в группе диплостомид на основании последовательностей ITS и cox1.
| Рубрика | Биология и естествознание |
| Вид | дипломная работа |
| Язык | русский |
| Дата добавления | 31.01.2018 |
| Размер файла | 2,0 M |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Рисунок 9. Дендрограмма филогенетических связей, построенная с использованием последовательностей ITS (метод NJ, модель K-2)
Как видно на рисунке 9, в дендрограмме на основе последовательностей ITS - виды LIN3 и LIN4 не дифференцируются на отдельные кластеры, в отличие от дендрограммы по cox1, а входят в комплекс `D. baeri' как один вид. Вероятно, эти линии более молодые, в которых митохондриальный ген накопил достаточное количество мутаций, для выделения их в отдельные линии (клады). В общей сложности, кластеризация по ITS совпадает с кластеризацией по cox1.
Рисунок 9. Дендрограмма филогенетических связей, построенная с использованием баркодовой последовательности cox1 диплостом (метод NJ, модель K-2)
Таким образом, с использованием последовательности cox1 (баркодинга) и последовательности ITS-кластера нам удалось оценить видовое разнообразие диплостом на территории Беларуси на всех стадиях жизненного цикла паразита и получить новые данные о промежуточных, дополнительных и дефинитивных хозяевах для D. mergi, D.sp. LIN2 и D.sp. LIN4.
Выводы
1. Определены полные первичные последовательности ITS-кластера рДНК и баркодовые последовательности митохондриального гена cox1 изучаемых диплостомид.
2. Исследуемые изоляты принадлежат к 5 видам и линиям: к двум широко распространенным в Евразии видам D. pseudospathaceum, D. spathaceum и к линии 2 комплекса `D. mergi'. Кроме того, обнаружены линии D.sp. LIN2, D.sp. LIN4 и D.sp. LIN6, зарегистрированных ранее в Исландии.
3. Виды D. pseudospathaceum и D. spathaceum идентифицированы нами на всех трех стадиях жизненного цикла, комплекс `D. mergi' на стадии церкарии и метацеркарии, D.sp. LIN4 и LIN6 на стадии церкарии и мириты. D.sp. LIN2 на стадии метацеркарии.
Список литературы
1. Лебедева Д.И. Трематоды рода Diplostomum Nordmann, 1832 рыб Ладожского озера // Паразитология. 2008. Т. 42. Вып. 4. С. 292-299.
2. Пугачев О.Н. Каталог паразитов пресноводных рыб Северной Азии. Трематоды. Санкт-Петербург: Изд-во Российская академия наук Зоологический институт, 2003. Том 298. 224 с.
3. Шедько М.Б. Распространение метацеркарий трематод семейства Diplostomidae в пресноводных экосистемах Приморья // Чтения памяти проф.Владимира Яковлевича Леванидова. 2001. Вып. 1. С. 96-104.
4. Яковлева Г. А., Лебедева Д. И., Иешко Е. П. трематоды водно-болотных птиц Карелии (по материалам 319-й союзной гельминтологической экспедиции 1958-1962 годов) // Труды Карельского научного центра Российской академии наук. - 2015. - №. 2. С. 95-110.
5. Шигин А.А. Трематоды фауны СССР. Род Diplostomum. Метацеркарии. М.: Наука. 1986. - 253с.
6. Судариков В.Е., Шигин А.А., Курочкин Ю.В., Ломакин В.В., Стенько Р.П., Юрлова Н.И. Метацеркарии трематод - паразиты пресноводных гидробионтов Центральной России. М.: Наука, 2002. 298 с.
7. Blasco-Costa I., Faltyґnkova A., Georgieva S., Skirnisson K., Scholz T., Kostadinova A. Fish pathogens near the Arctic Circle: molecular, morphological and ecological evidence for unexpected diversity of Diplostomum (Digenea: Diplostomidae) in Iceland //International journal for parasitology. - 2014. - Т. 44. - №. 10. - С. 703-715.
8. Georgieva S., Soldanova M., Perez-del-Olmo A., Dangel D., Sitko J., Sures B., Kostadinova A. Molecular prospecting for European Diplostomum (Digenea: Diplostomidae) reveals cryptic diversity //International journal for parasitology. - 2013. - Т. 43. - №. 1. - С. 57-72.
9. Locke S. A., Al-Nasiri F.S., Caffara M., Drago F., Kalbe M., Lapierre A.R., McLaughlin J.D., Overstreet R.M., Souza G.T.R., Takemoto R.M., Marcogliese D.J. Diversity, specificity and speciation in larval Diplostomidae (Platyhelminthes: Digenea) in the eyes of freshwater fish, as revealed by DNA barcodes // International journal for parasitology. - 2015. - Т. 45. - №. 13. - С. 841-855.
10. Selbach C., Soldanova M., Georgieva S., Kostadinova A., Sures B. Integrative taxonomic approach to the cryptic diversity of Diplostomum spp. in lymnaeid snails from Europe with a focus on the `Diplostomum mergi'species complex // Parasites & vectors. - 2015. - Т. 8. - №. 1. - С. 1-21.
11. Шигин А.А. К вопросу о плодовитости гельминтов // Паразитические черви домашних и диких животных. - Владивосток, 1965. С. 328-333.
12. Шигин А.А. Систематический обзор метацеркариев рода Diplostomum - паразитов рыб дельты Волги и Рыбинского водохранилища // Тр. Астрах. заповедника. 1968. Т.11. С. 275-324.
13. Шигин А. А. Изучение приживаемости церкарий Dіplostomum spathaceum (Trematoda, Diplostomidae) у рыб // Труды ГЕЛАН. - 1981. - Т. 31. - С. 150- 155.
14. Ризевский С. В., Климович Е. Н., Акимова Л. Н., Кузуб Н. Н., Курченко В. П. Оценка зараженности моллюсков личинками трематод на озере Нарочь
// Проблема церкариоза в Нарочанском регионе : материалы семинара, провед. ГПУ на базе УНЦ 1-2 нояб. 2006 г. Минск, 2007. С. 140-154.
15. Михеев В. Н. Моноксенные и гетероксенные паразиты рыб по-разному манипулируют поведением хозяев // Журнал общей биологии. Резюме статей. Том 72, № 3. 2011, С. 183-197.
16. Яковлева Г. А. Фауна трематод водно-болотных птиц Карелии: автореф. дис. канд. био. наук. Петрозаводск, 2013. 26 с.
17. Шигин А.А. Трематоды фауны России и сопредельных регионов. Род Diplostomum. Мариты. М.: Наука. 1993. - 208с.
18. Valtonen, E.T., Gibson, D.I. Aspects of the biology of diplostomid metacercarial (Digenea) populations occurring in fishes in different localities of northern Finland. Ann. Zool. Fennici 34, 1997. 47-59.
19. Moravec, F. Checklist of the metazoan parasites of fishes of the Czech Republic and the Slovak Republic (1873-2000). Academia, Prague, 2001.
20. Falty'nkova', A. Larval trematodes (Digenea) in molluscs from small water bodies near C'eske Bude'jovice. Czech Republic. Acta Parasitol. 50, 2005. 49-55.
21. Falty'nkova', A., Naљincova', V., Kabla'skova', L. Larval trematodes (Digenea) of the great pond snail, Lymnaea stagnalis (L.), (Gastropoda: Pulmonata) in Central Europe: a survey of species and key to their identification. Parasite 14, 2007. 39-51.
22. Sitko, J., Falty'nkova', A., Scholz, T. Checklist of the trematodes (Digenea) of birds of the Czech Republic and Slovakia. Academia, Praha, 2006.
23. Aaron G. Maule, Nikki J. Marks. Parasitic flatworms. CABI. 2006.
24. Niewiadomska, K. Present status of Diplostomum spathaceum (Rudolphi, 1819) and differentiation of Diplostomum pseudospathaceum nom. nov. (Trematoda: Diplostomatidae). Syst. Parasitol. 6, 1984. 81-86.
25. Bell, A.S., Sommerville, C. and Valtonen, E.T. A molecular phylogeny of the genus Ichthyocotylurus (Digenea, Strigeidae). International Journal for Parasitology 31, 2001. 833-842.
26. Radulovici A. E., Archambault P., Dufresne F. DNA barcodes for marine biodiversity: moving fast forward? // Diversity. - 2010. - Т. 2. - №. 4. - С. 450- 472.
27. Le T., Blair D., McManus D. Mitochondrial genomes of parasitic flatworms // TRENDS in Parasitology. 2002. V. 18. № 5. P. 206-213.
28. Blair D., Campos A., Cummings M. P., Laclette J. P. Evolutionary biology of parasitic Platyhelminth: the role of molecular phylogenetics. // Parasitology Today. 1996. V. 12. P. 66-71.
29. Vilas, R., Criscione, C.D., Blouin, M.S. A comparison between mitochondrial DNA and ribosomal internal transcribed regions in prospecting for cryptic species of platyhelminth parasites. Parasitology 131, 2005. 839-846.
30. Frйzal, L., Leblois, R. Four years of DNA barcoding: current advances and prospects. Infect. Genet. Evol. 8, 2008. 727-736.
31. Moszczynska, A., Locke, S.A., McLaughlin, J.D., Marcogliese, D.J., Crease,
T.J. Development of primers for the mitochondrial cytochrome c oxidase I gene in digenetic trematodes illustrates the challenge of barcoding parasitic helminths. Mol. Ecol. Resour. 9, 2009. 75-82.
32. Locke, S.A., McLaughlin, J.D., Dayanandan, S., Marcogliese, D.J. Diversity, specificity and evidence of hybridization in Diplostomum spp. metacercariae in freshwater fishes is revealed by DNA barcodes and ITS sequences. Int. J. Parasitol. 40, 2010. 333-343.
33. Locke, S.A., McLaughlin, J.D., Marcogliese, D.J. DNA barcodes show cryptic diversity and a potential physiological basis for host specificity among Diplostomoidea (Platyhelminthes: Digenea) parasitizing freshwater fishes in the St. Lawrence River. Can. Mol. Ecol. 19, 2010. 2813-2827.
34. Лопаткин А. А. Изучение особенностей молекулярной эволюции птичьих шистосом (Trematoda: Schistosomatidae): автореф. дис. канд. био. наук. Москва, 2011. 27 с.
35. Faltэnkovб A., Sures B., Kostadinova A. Biodiversity of trematodes in their intermediate mollusc and fish hosts in the freshwater ecosystems of Europe // Systematic parasitology. - 2016. - Т. 93. - №. 3. - С. 283-293.
36. Selbach C. et al. Integrative taxonomic approach to the cryptic diversity of Diplostomum spp. in lymnaeid snails from Europe with a focus on the `Diplostomum mergi' species complex // Parasites & vectors. - 2015. - Т. 8. - №. 1. - С. 1-21.
Приложение
Таблица 1. Сводная таблица на основе морфологических данных
|
№ |
Вид паразита |
Промежуточный хозяин |
Дополнительный хозяин |
Дефинитивный хозяин |
||
|
Вид |
Локализация |
|||||
|
1 |
D. chromatophorum |
Lymnaea stagnalis, L. palustris, L. ovata2 |
Род Cyprinus (карповые), Oncorhynchus (тихоокеан. лососи), Esox (щука), Perca (речной окунь)1 Пыжьян2 и др. |
Хрусталик1,2,3, стекловидное тело2 |
Чайковые2,3 |
|
|
2 |
D. commutatum |
L. stagnalis, L. auricularia, L. lagotis, L. ovata, L. peregra, L. palustris, L. fusca, L. truncatula, L. glutinosa, L. corvus4 |
Лещ1 |
Хрусталик1,3 |
Речная крачка4 |
|
|
3 |
D. gasterostei |
L. ovata2 |
Род Coregonus (сиги), Osmerus (корюшки), Gymnocephalus (ёрш), Salvelius (гольцы)1,2 |
Глазное дно1, пигментный слой2, жидкие среды глаза3. |
||
|
4 |
D. gavium |
(?) сем. Lymnaeidae4 |
Род Myoxocephalus (керчаки), Perca, Osmerus1, Rutilus (плотва)2 |
Глазное дно1 стекловидное тело2 |
Чернозобая гагара4 |
|
|
5 |
D. gobiorum |
L. auricularia2 |
Подкаменщик1 Сазан, серебряный карась, щука2 |
Хрусталик1 Глаза2 |
Крачки2 |
|
|
6 |
D. helveticum |
L. auricularia, L. |
Лососевые, сиговые, щуковые, |
Хрусталик1,2,3 |
Чайковые2 |
|
|
ovata, L. peregra и L. limosa2 |
карповые, окуневые и некоторые др.2 |
|||||
|
7 |
D. huronense |
L. stagnalis, L. auricularia, L. bactriana и L. fontinalis2 |
Род Cyprinus, Rutilus, Cobitis (щиповки), Gobio (пескари), Esox, Carassius, и др.1,2 |
Хрусталик1,2,3 стекловдое тело2 |
||
|
8 |
D. mergi |
L. auricularia и L. stagnalis2,4 |
Карповые1,2,3, сиговые, окуневые и др.2 |
Хрусталик1,2 |
Крохали2,4 |
|
|
9 |
D. nordmanni |
L. bactriana, L. fontinalis, L. lagotis2 |
Синец, плотва, лещ, сырть, язь, окунь1,2 |
Хрусталик1,2 |
Чайковые2 |
|
|
10 |
D. parviventosum |
L. lagotis, L. ovata |
Плотва1,5 Речная абботтина, пескарь3 |
Головной мозг1 Хрусталик3 |
Крохаль5 |
|
|
11 |
D. petromyzifluviatilis |
Bithynia tentaculata5 |
Речная минога, украинская минога, европейская речная минога5 |
Головной мозг5 |
Кряква5 |
|
|
12 |
D. phoxini |
L. auricularia, L. peregra и L. ovata2 |
род Phoxinus1,2 |
Головной мозг1,2 Чернепно-мозговая полость2. |
Крохали, домашние утки, мыши и крысы в эксп.2 |
|
|
13 |
D. pungiti |
неизв. |
Колюшка трехиглая1,2 окунь2 |
Донная часть глазного яблока1 Стекловидное тело2 |
Крохали, луток, хохлатая чернеть, домашняя утка в эксп.2 |
|
|
14 |
D. pusillum |
неизв. |
рыбы рода Barbatula (голец)1,2 |
Между склерой и ретиной1,2 |
Ондатра, хохлатая чернеть, черноголовый |
|
|
15 |
D. repandum |
неизв. |
Арктический голец, даллия2 |
Дно глаза2. |
Крачки и цапли2 |
|
|
16 |
D. rutili |
L. ovata, L. fontinalis и L. bactriana2 |
Род Carassius, Coregonus, Cyprinus1,3, Esox и др.2 |
Хрусталик1,2,3 |
Чайковые2 |
|
|
17 |
D. spathaceum |
L. auricularia, L. peregra, L. bactriana и L. nuttaliana2 |
Род Cobitis (щиповки), Gobio (пескари), Sander (судак), Esox, Cyprinus, Rutilus, Carassius, и др.1,2 |
Хрусталик, стекловидное тело, мозг, пигментный слой глаз, дно глаза мышцы, почки, сердце, полость тела, жабры, кишечник2 |
Чайковые2 |
|
|
18 |
D. volvens |
L. auricularia и L. ovata2 |
Окунь, налима, пелядь, радужная форель, девятииглая колюшка2 |
Стекловидное тело, между склерой и ретиной, хрусталик, глазное дно2 |
Чайковые2, крачки, поморники6 |
Размещено на Allbest.ru
Подобные документы
Анализ зараженности моллюсков (как промежуточных хозяев трематод) реки Сож и прилегающих водоемов. Жизненный цикл трематод, их особенности, внешнее и внутреннее строение. Эпидемиологическое и эпизоотическое значение трематоды Paramphistomum cervi.
дипломная работа [1,1 M], добавлен 02.05.2015Изучение частной микробиологии, систематики и методов идентификации бактерий рода Listeria, возбудителей острой инфекционной болезни, особенности морфологии и физиологии. Экология и распространение данных бактерий, медицинское и ветеринарное значение.
курсовая работа [577,3 K], добавлен 23.01.2011Особенности биологии и экологии рода воронов. Значение рода воронов в научной и хозяйственной деятельности человека, их распространенность. Эколого-географическая характеристика птиц. Описание мест учёта птиц, полевые признаки и рацион питания воронов.
дипломная работа [2,5 M], добавлен 27.01.2018Возбудители протозойных заболеваний. Кокцидиоз семенников сельдевых. Заражение морских рыб взрослыми формами трематод. Методика исследования инвазионных заболеваний. Эпидемиологическое значение паразитов морских рыб. Болезни, вызываемые инфузориями.
курсовая работа [48,9 K], добавлен 04.10.2011Особенности биологии и экологии птиц. Видовое разнообразие, численность, система связей лесных птиц, их роль в жизни лесных биоценозов. Определение степени влияния антропогенного фактора на численность массовых видов птиц рекреационной зоны реки Сож.
курсовая работа [7,7 M], добавлен 24.03.2014Место плоских червей в эволюционной иерархии животного мира, сравнительная характеристика различных классов. Изучение особенностей, основных признаков строения и жизненного цикла турбеллярий, трематод, цестод, их роль в заболеваниях человека и животных.
реферат [50,9 K], добавлен 18.09.2011Единицы учета и показатели численности эктопаразитов. Изученность фауны паразитов и обитателей гнезд хищных птиц. Видовой состав эктопаразитов орлов, мелких соколиных. Оценка отрицательного воздействия паразитов и вызываемых ими болезней на хозяина.
дипломная работа [4,3 M], добавлен 27.05.2013Особенности строения и жизненного цикла ленточного червя. Пагубное влияние червя на организм. Наиболее яркие представители класса Cestoda. Особенности, основные признаки, строение турбеллярий, трематод, цестод, их роль в заболеваниях человека и животных.
реферат [31,6 K], добавлен 25.04.2015Причины межсезонных перелетов птиц. Виды перелетных и оседлых птиц, их характерные особенности. Определенный порядок расположения птиц в стае. Причины массовой гибели птиц на зимовках. Наблюдение и изучение учеными поведения птиц во время перелетов.
презентация [813,4 K], добавлен 09.11.2010Общая характеристика и уровень синантропизации орнитофауны г. Вологда. Видовое разнообразие и население птиц в парке Ветеранов. Сезонная динамика видового состава и плотности птиц на разных участках парка. Особенности экологии и биологии птиц парка.
дипломная работа [1,6 M], добавлен 07.10.2016