Аллельные варианты генов-кандидатов подверженности туберкулезу у русского населения Западной Сибири
Роль наследственных факторов в возникновении и развитии туберкулеза. Молекулярные механизмы патогенеза туберкулеза у человека. Физиологические функции белковых продуктов генов-кандидатов. Молекулярно–генетические методы анализа полиморфизма генов.
Рубрика | Медицина |
Вид | дипломная работа |
Язык | русский |
Дата добавления | 11.08.2010 |
Размер файла | 851,1 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Естественный отбор в теории популяционной генетики является важнейшим фактором эволюции, вызывающим адаптивные изменения в генетической структуре популяций. В случае формирования гаметического неравновесия между маркерами под воздействием естественного отбора, определенные комбинации аллелей разных локусов дают селективные преимущества их носителям и, следовательно, сохраняются при отборе и накапливаются в популяции [Алтухов Ю.П., 2003].
3.2 Анализ связи полиморфизма генов NRAMP1, IL12B, VDR, IL1B, IL1RN с туберкулезом
Туберкулез - инфекционное заболевание, обладающее клиническим полиморфизмом. Специфическая гранулема - субстрат болезни - может развиться в любом органе или ткани [Cтруков А.И., Кауфман О.Я., 1989; Ерохин В.В., Земскова З.С., 2003]. Современная классификация туберкулеза, в основу которой положено два признака: локализация процесса и клинико - рентгенологические особенности форм, насчитывает 23 основных клинических формы туберкулеза [Хоменко А.Г., 1996]. Такое разнообразие проявлений одного заболевания определяют множество факторов. Несомненно, в этом случае играют немаловажную роль свойства самой микобактерии туберкулеза, такие как вирулентность, резистентность к противотуберкулезным препаратам, а также массивность инфекции. От состояния естественных защитных сил организма (барьерная функция слизистой оболочки дыхательных путей и желудочно-кишечного тракта) также будет зависеть исход встречи человека и микобактерии туберкулеза.
Результаты современных генетических исследований не оставили сомнений в существовании наследственной предрасположенности к туберкулезу [Хоменко А.Г., 1996; Чуканова В.П., 2001; Hill A.V.S., 1999]. Они показали, что одной из причин, определяющих такое разнообразие клинических проявлений, является полиморфизм генов, чьи продукты экспрессии вовлечены в патогенез заболевания. В то же время, пока не ясно, какие именно варианты генов имеют решающее значение. В связи с этим важно изучить вклад конкретных сочетаний аллелей в развитие болезни.
В исследованной выборке 304 больных туберкулезом русских жителей г. Томска и Томской области проанализировано распределение генотипов и частот аллелей полиморфизма генов NRAMP1, IL12B, VDR, IL1B, IL1RN (табл. 10). Выявлено отклонение наблюдаемого распределения генотипов полиморфизма B/b гена VDR от ожидаемого при РХВ (ч2=6,95; р=0,008) за счет повышенной гетерозиготности (табл. 10). Учитывая неслучайный характер отбора индивидов в выборке, можно предположить наличие вероятного вклада гена VDR в патогенез туберкулеза. Для исследованных полиморфизмов генов NRAMP1, IL12B, IL1B, IL1RN в общей группе больных туберкулезом отклонение от РХВ не показано.
Известно, что у жителей Тувы больных туберкулезом выявлено отклонение от РХВ для полиморфизмов 1465-85G/A и D543N гена NRAMP1 за счет пониженного количества гетерозигот в обоих случаях и для полиморфизмов B/b и F/f гена VDR за счет повышенной гетерозиготности [Рудко А.А., 2004]. Таким образом, как для русских, так и для тувинцев, больных туберкулезом, характерно повышенное количество гетерозигот B/b гена VDR. Сравнение частот аллелей и генотипов у русских и тувинцев, больных туберкулезом, показало статистически значимые отличия для всех исследованных полиморфных маркеров (табл. 11). Максимальная степень отличий частот аллелей и генотипов показана для полиморфизма B/b гена VDR.
Таблица 10 Частоты аллелей и генотипов исследованных полиморфизмов у больных туберкулезом
Ген |
Поли-морфизм |
Гено-типы |
N.O. |
N.E. |
Частота аллеля |
ч2 (d.f.) |
Hobs |
Hexp |
D |
|
NRAMP1 |
469+14 G/C |
GG GC CC |
179 94 6 |
183,07 85,86 10,07 |
G= 0,810 |
2,25 (1) |
0,337 |
0,308 |
+0,095 |
|
D543N |
DD DN NN |
263 14 1 |
262,23 15,54 0,23 |
D= 0,971 |
1,28 (1) |
0,050 |
0,056 |
-0,099 |
||
1465-85 G/A |
GG GA AA |
126 126 27 |
128,03 121,94 29,03 |
G= 0,677 |
0,25 (1) |
0,452 |
0,437 |
+0,033 |
||
274C/T |
CC CT TT |
163 122 14 |
167,82 112,37 18,81 |
C= 0,749 |
2,01 (1) |
0,408 |
0,376 |
+0,086 |
||
IL12B |
1188A/C |
AAACCC |
16210017 |
161,09101,8216,09 |
A=0,760 |
0,05(1) |
0,358 |
0,365 |
-0,018 |
|
VDR |
B/b |
BBBbbb |
4916876 |
60,37145,2687,37 |
b=0,546 |
6,95*(1) |
0,573 |
0,496 |
+0,157 |
|
F/f |
FFFfff |
12413440 |
122,42137,1638,42 |
F=0,641 |
0,12(1) |
0,450 |
0,460 |
-0,023 |
||
IL1B |
+3953A1/A2 |
A1A1A1A2A2A2 |
16910824 |
165,21115,5720,22 |
A10,741 |
1,16(1) |
0,359 |
0,384 |
-0,066 |
|
IL1RN |
VNTR |
A1A1A1A2A1A3A1A4A2A2A2A3другие |
1581001012541 |
152,43110,1611,530,4319,904,170,38 |
A1=0,714A2=0,258A3=0,027 |
6,35(6) |
0,385 |
0,422 |
-0,088 |
Примечание. Обозначения см. табл. 6
Таблица 11 Сравнение частот аллелей и генотипов у русских и тувинцев с ТБ
Полимор-физм |
Гено-типы |
Частоты (%) |
p |
Ал-лели |
Частоты |
p |
|||
русские |
тувинцы |
русские |
тувинцы |
||||||
NRAMP1 |
|||||||||
469+14 G/C |
GG GC CC |
179 (64,2) 94 (33,7) 6 (2,1) |
198 (85) 32 (13,7) 3 (1,3) |
0,000 |
G |
0,810 |
0,918 |
0,000 |
|
D543N |
DD DN NN |
263 (94,6) 14 (5) 1 (0,4) |
191 (80,9) 39 (16,5) 6 (2,6) |
0,000 |
D |
0,971 |
0,892 |
0,000 |
|
1465-85G/A |
GG GA AA |
126 (45,2) 126 (45,2) 27 (9,6) |
153 (65,7) 63 (27) 17 (7,3) |
0,000 |
G |
0,677 |
0,794 |
0,000 |
|
274C/T |
CC CT TT |
163 (54,5) 122 (40,8) 14 (4,7) |
190 (80,5) 45 (19,1) 1 (0,4) |
0,000 |
C |
0,749 |
0,900 |
0,000 |
|
IL12B |
|||||||||
1188 A/C |
AA AC CC |
162 (58) 100 (35,8) 17 (6,2) |
90 (38,6) 102 (43,8) 41 (17,6) |
0,000 |
A |
0,760 |
0,605 |
0,000 |
|
VDR |
|||||||||
B/b |
BB Bb bb |
49 (16,7) 168 (57,3) 76 (26) |
3 (1,3) 82 (35) 149 (63,7) |
0,000 |
b |
0,546 |
0,812 |
0,000 |
|
F/f |
FF Ff ff |
124 (41,6) 134 (45) 40 (13,4) |
125 (53,6) 102 (43,8) 6 (2,6) |
0,000 |
F |
0,641 |
0,755 |
0,000 |
|
IL1B |
|||||||||
+3953 A1/A2 |
A1A1 A1A2 A2A2 |
169 (56,1) 108 (35,9) 24 (8) |
185 (79,1) 47 (20) 2 (0,9) |
0,000 |
A1 |
0,741 |
0,891 |
0,000 |
Примечание. р - достигнутый уровень значимости при сравнении частот аллелей и генотипов
У русских с ТБ и здоровых по сравнению с жителями Тувы чаще наблюдали гомозиготный по аллелею В и гетерозиготный генотипы. Среди жителей г. Томска, больных туберкулезом, по сравнению с тувинцами статистически значимо чаще встретились аллели 469+14C, 1465-85A, 274T гена NRAMP1, f гена VDR, и +3953А2 гена IL1В, реже регистрировались аллели 543N гена NRAMP1 и 1188С гена IL12B. В целом можно отметить, что отличия в распределении генотипов и аллелей между русскими и тувинцами были идентичными у больных и здоровых: у русских с туберкулезом преобладали те же аллели генов, что и у здоровых.
При сравнении распределений генотипов и частот аллелей в выборках больных и здоровых лиц, живущих в г. Томске и Томской области, выявлены статистически значимые отличия для полиморфизма 274С/Т гена NRAMP1 и трех генов, принимающих участие в продукции интерлейкинов (табл. 12). Так, у больных туберкулезом статистически значимо чаще регистрировался гетерозиготный генотип 274С/Т гена NRAMP1 (OR=1,66, 95%CI:1,02-2,71; p=0,040). Лица, обладающие гомозиготным генотипом 274С/C чаще встречались среди здоровых (OR=0,54, 95%CI:0,33-0,87; р=0,010). Показаны отличия частот аллелей у больных и здоровых для полиморфизма +3953 А1/А2 гена IL1B (p=0,036) за счет повышения доли аллеля А2 у больных туберкулезом. В тоже время, не найдено отличий при сравнении распределения генотипов этого полиморфизма гена IL1В (табл. 12).
Различия по VNTR полиморфизму гена IL1RN в выборках больных и здоровых касались как частот аллелей, так и частот генотипов. Аллель А2 статистически значимо чаще встречался у пациентов с туберкулезом. При сравнении частот генотипов выявлено более высокое количество гетерозигот А1/А2 у больных туберкулезом по сравнению с контролем (OR=2,10, 95%CI:1,26-3,51, р=0,003) (табл. 12). В противоположность этому у африканцев гетерозиготы по аллелю А2 IL1RN статистически значимо реже встречались у больных туберкулезом, чем в контрольной группе [Bellamy R., Ruwende C., 1998].
Найдена ассоциация полиморфизма 1188А/С гена IL12В с туберкулезом. Установлено, что распределение генотипов и частота аллелей в группах больных и здоровых различаются. В выборке больных статистически значимо чаще встречаются гомозиготы по аллелю 1188С (р=0,035). В данном случае вероятность заболеть туберкулезом обладателей гомозиготного генотипа 1188С/С значимо выше, чем у индивидов с гомозиготным генотипом 1188А/А и гетерозиготным (OR=8,31, 95%CI:1,15-169,30, р=0,030) (табл. 12). Несмотря на отклонение распределения генотипов от ожидаемого при РХВ полиморфизма B/b гена VDR у больных туберкулезом, не показано отличий между больными и здоровыми.
Диагноз туберкулеза устанавливается на основании наличия у больного характерных жалоб, эпидемиологического анамнеза, анамнеза заболевания, клинических симптомов, характерных изменений в общем анализе крови и рентгенологической картины. Однако только при обнаружении микобактерий туберкулеза (МБТ) в мокроте диагноз туберкулеза можно считать верифицированным [Рабухин А.Е.,1976].
Учитывая это, при дальнейшем анализе из общей группы больных была выделена выборка пациентов с бактериовыделением (МБТ+) (n=234). При сравнении распределения генотипов и частот аллелей в группах больных лабораторно подтвержденным туберкулезом и контрольной, найдены статистически значимые отличия для полиморфизма 274С/Т гена NRAMP1, аллельного варианта +3953 А1/А2 гена IL1B, VNTR полиморфизма гена IL1RN и полиморфизма 1188А/С IL12В (табл. 13). Частота аллеля 274Т гена NRAMP1 была выше в группе больных (р=0,009). Показана протективная роль генотипа 274С/С (OR=0,53, 95%CI: 0,32- 0,88, р=0,012).
Таблица 12 Статистические показатели для сравнения частот аллелей и генотипов у больных туберкулезом и здоровых
Ген |
Полимор-физм |
Гено-типы |
Сравнение |
OR (95%CI) |
||
Генотипов р |
Аллелей р |
|||||
NRAMP1 |
469+14 G/C |
GG GC CC |
0,393 |
0,229 |
0,74 (0,46-1,18) 1,32 (0,83-2,13) 1,48 (0,27-10,77) |
|
D543N |
DD DN |
0,283 |
0,377 |
1,66 (0,70-3,88) 0,56 (0,24-1,34) |
||
1465-85 G/A |
GG GA AA |
0,134 |
0,312 |
0,70 (0,45-1,08) 1,54 (0,99-2,41) 0,86 (0,42-1,76) |
||
274C/T |
CC CT TT |
0,009 |
0,020 |
0,54* (0,33-0,87) 1,66* (1,02-2,71) 2,80 (0,59-18,13) |
||
IL12B |
1188 A/C |
AA AC CC |
0,035 |
0,044 |
0,72 (0,45-1,13) 1,12 (0,70-1,78) 8,31* (1,15-169,30) |
|
VDR |
B/b |
BB Bb bb |
0,925 |
0,791 |
0,94 (0,51-1,76) 0,96 (0,60-1,54) 1,10 (0,64-1,91) |
|
F/f |
FF Ff ff |
0,705 |
0,469 |
1,20 (0,75-1,93) 0,89 (0,57-1,41) 0,88 (0,46-1,69) |
||
IL1B |
+3953 A1/A2 |
A1A1 A1A2 A2A2 |
0,108 |
0,036 |
0,70 (0,45-1,08) 1,21 (0,77-1,90) 2,32 (0,82-7,10) |
|
IL1RN |
VNTR |
A1A1 A1A2 A2A2 |
0,030 |
0,023 |
0,57* (0,36-0,88) 2,10* (1,26-3,51) 0,97 (0,45-2,13) |
Примечание. р - достигнутый уровень значимости; OR - величина отношения шансов; (95%CI) - доверительный интервал для OR; * - р < 0,05
Таблица 13 Статистические показатели для сравнения частот аллелей и генотипов у больных лабораторно подтвержденным туберкулезом и здоровых
Полимор-физм |
Гено-тип |
N |
р |
OR (95% СI) |
Частота аллеля |
р |
|
NRAMP1 |
|||||||
274С/Т |
CC CT TT |
126 94 12 |
0,021 |
0,53* (0,32-0,88) 1,64* (0,99-2,73) 3,11 (0,64-20,47) |
C=0,746 |
0,009 |
|
IL12B |
|||||||
1188 А/С |
AA AC CC |
125 82 12 |
0,044 |
0,69 (0,43-1,11) 1,20 (0,74-1,94) 7,42* (0,99-154,58) |
A=0,758 |
0,046 |
|
IL1B |
|||||||
+3953 А1/А2 |
A1A1 A1A2 A2A2 |
131 82 21 |
0,080 |
0,69 (0,44-1,09) 1,16 (0,73-1,87) 2,64 (0,91-8,21) |
A1=0,735 |
0,036 |
|
IL1RN |
|||||||
VNTR |
A1A1 A1A2 A2A2 другие |
121 79 21 11 |
0,042 |
0,55* (0,35-0,87) 2,16* (1,28-3,68) 1,06 (0,48-2,38) - |
А1=0,707 A2=0,267 A3=0,024 A4=0,002 |
0,029 |
Примечание. р - достигнутый уровень значимости; OR - величина отношения шансов; (95%CI) - доверительный интервал для OR; N - количество индивидов с определенным генотипом; *- p < 0,05
Рисковыми для туберкулеза оказались генотипы 274С/Т и 274Т/Т гена NRAMP1. Не найдено отличий в распределении частот генотипов +3953 А1/А2 полиморфизма гена IL1B, в то время как аллель А2 статистически значимо чаще встречался в группе больных лабораторно подтвержденным туберкулезом, чем в группе здоровых индивидов (р=0,036) (табл. 13). Ассоциация VNTR полиморфизма гена IL1RN, а имменно связь А2 аллеля с туберкулезом, прослеживается как в общей выборке больных, так и в группе пациентов с наличием МБТ в мокроте. При анализе результатов подсчета отношения шансов показана более высокая подверженность туберкулезу индивидов с генотипом А1/А2 (OR=2,16, 95%CI:1,28-3,68, p=0,003). Протективным эффектом обладал полиморфизм А1А1 гена IL1RN (OR=0,55).
Для полиморфизма 1188А/С гена IL12B выявлены различия между больными туберкулезом МБТ+ и здоровыми по частотам аллелей (р=0,046) и генотипов (р=0,044). У больных туберкулезом чаще, чем в контрольной группе регистрировался гомозиготный генотип 1188С/С, риск развития туберкулезного процесса у этих индивидов был в семь раз выше, чем у обладателей других генотипов этого полиморфизма.
Различают первичный туберкулез, который развивается в ранее не инфицированном МБТ организме, а также вторичный генез туберкулеза, когда заболевание возникает при повторном инфицировании. Микобактерии туберкулеза проникают в организм различными путями. При небольшом их количестве, слабой вирулентности и при достаточной устойчивости организма они могут не вызвать специфических изменений на месте внедрения, а также и при лимфо-гематогенном рассеивании. Возникает состояние латентного микробизма [Земскова З.С., Дорожкова И.Р., 1984]. В дальнейшем может развиться инфицирование МБТ, когда возбудитель находится в макроорганизме, но человек не заболевает туберкулезом. При других условиях в результате первичного заражения образуются туберкулезные очаги в том или ином органе (первичный туберкулез).
Если же на фоне инфицирования в организм дополнительно попадет новая порция вирулентных микобактерий, может развиться заболевание, которое будет иметь вторичный генез (вторичный туберкулез). Наличие факторов, приводящих к снижению общей и местной резистентности организма, таких как курение, сахарный диабет, кортикостероидная терапия, лечение цитостатиками, ВИЧ-инфицирование и другие, увеличит вероятность этого события. Также вторичный туберкулез может возникнуть в результате обострения перенесенного в прошлом первичного процесса.
Патогенетические механизмы первичных и вторичных форм туберкулеза разнятся. Поэтому различаются и клинические формы, характерные для этих двух групп. Если для первичного туберкулеза свойственно поражение лимфатических узлов средостения или мезентериальных и, как осложнение, легочной ткани (исключение составляет первичный туберкулезный комплекс, при котором первичный аффект формируется в легком), то при вторичном генезе туберкулеза, как правило, поражается легочная ткань.
В связи с этим фактом можно предположить, что резистентность макроорганизма к первичному и вторичному туберкулезу обусловлена разными факторами иммунитета, а значит, варианты генов, приводящие к предрасположенности к разным по генезу формам туберкулеза, также будут различаться. В ходе дальнейшего анализа больные туберкулезом были поделены на две группы в зависимости от того, на каком этапе симбиоза человека и микобактерии произошло заболевание. В выборку больных с первичным туберкулезом были отнесены пациенты, у которых выставили диагнозы: туберкулез внутригрудных лимфоузлов (n=36), первичный туберкулезный комплекс (n=3), гематогенно-диссеминированный туберкулез легких первичного периода (n=2), плеврит туберкулезной этиологии первичного периода (n=2). Сравнение частот аллелей и распределений генотипов в выборках больных первичным туберкулезом и контрольной показало наличие ассоциации с заболеванием полиморфизма 1465-85G/A гена NRAMP1: найдены статистически значимые различия частот аллелей (р=0,047) и генотипов (р=0,004) этого полиморфизма в группах больных и здоровых. У заболевших первичным туберкулезом чаще, чем в контрольной группе, встречался гетерозиготный генотип 1465-85G/A, риск заболевания у этих индивидов был три раза выше, чем у обладателей других генотипов этого полиморфизма (OR=3,16, 95%CI:1,47-6,86; р=0,002) (табл. 14). Показано, что генотип 1465-85G/G чаще регистрировался у здоровых индивидов (OR=0,33, 95%CI:0,15-0,73; р=0,005), таким образом, установлена его протективная роль в отношении первичного туберкулеза.
Таблица 14 Cтатистические показатели для сравнения частот аллелей и генотипов полиморфизма 1465-85 G/A гена NRAMP1 у больных туберкулезом первичного периода и здоровых
Полиморфизм |
Гено-тип |
N |
р |
OR (95%CI) |
Частота аллеля |
р |
|
1465-85 G/A |
GG GA AA |
12 27 4 |
0,004 |
0,33* (0,15-0,73) 3,16* (1,47-6,86) 0,82 (0,22-2,86) |
G=0,593 |
0,047 |
Примечание. Обозначения см. табл. 13
Известно, что продукт гена Nramp1 у мышей участвует в процессе фагоцитоза, влияя на судьбу МБТ в макроорганизме. Кроме того, на мышах показано, что именно ранняя фаза инфекции с микобактериями туберкулеза штамма BCG находится под контролем гена Nramp1 [Scamene E. et al., 1980]. По всей видимости, дефект продукции или функции человеческого гомолога Nramp1 при первой встрече человека с микобактерией может способствовать возникновению заболевания. Тогда, как в организме инфицированного ранее индивида срабатывают механизмы иммунологической защиты, и мутации в гене, а следовательно и дефекты белка NRAMP1 не оказывают подобного влияния.
Ранее показано, что полиморфизм 1465-85G/A гена NRAMP1 оказывает предрасполагающую роль к инфильтративному туберкулезу у тувинцев [Рудко А.А., 2004]. Частота гомозигот А/А этого полиморфизма была практически в два раза выше у больных ТБ, чем у здоровых. Учитывая результаты исследования генетических основ подверженности к туберкулезу русских и тувинцев, можно отметить, что ген NRAMP1 оказывает влияние на предрасположенность к заболеванию, проявляя этническую специфичность.
Выборку больных с вторичным происхождением туберкулеза составили пациенты с установленным диагнозом инфильтративного туберкулеза легких (150 человек), диссеминированного туберкулеза легких (65 человек), очагового туберкулеза (27 человек), казеозной пневмонии (5 человек), впервые выявленного фиброзно-кавернозного туберкулеза легких (4 человека), туберкуломы (4 человека), туберкулеза почечной паренхимы (3 человека), туберкулеза бронха (2 человека), плеврита туберкулезной этиологии (1 человек). Всем больным диагноз туберкулеза был установлен впервые.
При сравнении частот аллелей и распределений генотипов ассоциацию с вторичным туберкулезом продемонстрировали полиморфизм 274С/Т гена NRAMP1, полиморфный маркер гена IL1В, VNTR полиморфизм гена IL1RN, а также ген IL12B (табл. 15). Аллель 274Т гена NRAMP1 чаще встречался в группе больных (р=0,005), причем у лиц гетерозиготных по этому полиморфизму риск заболеть туберкулезом возрастал в 1,75 раза (95%СI:1,06-2,88; p=0,026), а у гомозигот 274Т/Т шанс заболеть был в пять раз выше, чем у обладателей других генотипов этого полиморфизма (95%CI:1,07-33,72; p=0,037).
Показано, что генотип 274С/С статистически значимо чаще встречался у здоровых лиц (OR=0,51, 95%CI:0,31-0,82; p=0,005). В целом, сравнивая результаты, полученные при исследовании частот аллелей и генотипов у больных первичным и вторичным туберкулезом, можно отметить, что разные полиморфизмы гена NRAMP1 оказывают неравнозначное влияние на предрасположенность к туберкулезу у русских г. Томска.
Таблица 15 Статистические показатели для сравнения частот аллелей и генотипов у больных вторичным туберкулезом легких и здоровых
Полимор-физм |
Гено-тип |
N |
р |
OR (95% СI) |
Частота аллеля |
р |
|
NRAMP1 |
|||||||
274С/Т |
CC CT TT |
136 108 13 |
0,010 |
0,51* (0,31-0,82) 1,75* (1,06-2,88) 5,01* (1,07-33,72) |
C=0,739 |
0,005 |
|
IL1B |
|||||||
+3953 А1/А2 |
A1A1 A1A2 A2A2 |
146 92 21 |
0,103 |
0,70 (0,45-1,10) 1,19 (0,75-1,89) 2,36 (0,82-7,34) |
A1=0,741 |
0,041 |
|
IL1RN |
|||||||
VNTR |
A1A1 A1A2 A2A2 другие |
134 89 23 12 |
0,025 |
0,55* (0,35-0,86) 2,20* (1,31-3,72) 1,04 (0,48-2,31) - |
А1=0,705 A2=0,269 A3=0,023 A4=0,003 |
0,019 |
Примечание. р - достигнутый уровень значимости; OR - величина отношения шансов; (95%CI) - доверительный интервал для OR; N - количество индивидов с определенным генотипом; *- p < 0,05
Показано, что полиморфизм 1465-85 G/A гена NRAMP1 проявил связь с первичным туберкулезом. Учитывая, что при аналогичном сравнении частот генотипов и аллелей в выборках больных вторичными формами туберкулеза и здоровых, различий не было найдено, полученные данные позволяют предположить наличие влияния этого полиморфизма на более раннее возникновение заболевания. Полиморфный вариант 274С/Т оказался ассоциированным с вторичным генезом заболевания. Для маркеров D543N и 469+14G/C гена NRAMP1 не показано предрасполагающего влияния на ТБ у русских жителей г. Томска.
Известно, что IL-1в является провоспалительным цитокином, а значит, его варианты могут приводить к ослаблению защитной реакции организма и, как следствие, способствовать заболеванию при наличии возбудителя в организме. Выявлены различия частот аллелей при сравнении группы контроля и больных вторичным туберкулезом, при которых заболевание ассоциированно с аллелем А2 IL1В (ч2=4,17, р=0,041). Продукт гена IL1RN является рецепторным антагонистом IL-1в, выполняя функцию специфического блокатора биологического действия IL-1в. Показано, что аллель А2 приводит к увеличению продукции белка IL-1RN [Wilkinson R. J. et al., 1999].
Выявлено статистически значимое увеличение частоты аллеля А2 VNTR полиморфизма гена IL1RN у больных по сравнению с контролем (ч2=9,92, р=0,019). Распределение генотипов этого полиморфизма также различалось в группах лиц с вторичным туберкулезом и здоровых (ч2=14,49, р=0,025): у больных чаще регистрировался гетерозиготный генотип А1/А2, риск развития заболевания у них был выше более чем в 2 раза, по сравнению с лицами с другими генотипами этого полиморфизма (95%CI: 1,31-3,72, р=0,002). Протективная роль в развитии вторичного туберкулеза показана для генотипа А1/А1, так как он статистически значимо чаще встречен у здоровых (OR=0,55, 95%CI: 0,35-0,86, р=0,007).
В целом, сравнение общей группы больных туберкулезом, выборки пациентов-бактериовыделителей, больных вторичным ТБ с контрольной выборкой показало аналогичные результаты, то есть связь полиморфизмов 274С/Т гена NRAMP1, +3953 А1/А2 гена IL1B и VNTR гена IL1RN с заболеванием. Общую выборку больных на 86% составили пациенты с вторичным туберкулезом. При первичном туберкулезе, как правило, не встречается выделение МБТ с мокротой [Рабухин А.Е., 1976]. В исследовании жителей г. Томска только один больной с первичным туберкулезным комплексом был бактериовыделителем. Так, выборка больных туберкулезом МБТ+ практически на 100% состояла из пациентов с туберкулезом вторичного периода. Таким образом, полиморфизм 274С/Т гена NRAMP1, +3953 А1/А2 полиморфизм гена IL1B и VNTR полиморфизм IL1RN проявили ассоциацию с вторичным туберкулезом. Тем более, что ассоциации, найденные при сравнении первичного туберкулеза с контролем, затрагивали иные гены.
Найдена связь полиморфизма 1188А/С гена IL12B как с первичным, так и с вторичным туберкулезом, причем генотип 1188С/С чаще встречался у больных, чем у здоровых (табл. 16). Это наблюдение вполне объяснимо, поскольку известно, что IL-12 участвует в активации макрофагов посредством Т-хелперов, вырабатывающих INF-г, а активизированные макрофаги, в свою очередь, устремляются к месту нахождения микобактерий и активно их поглощают. Вероятно, варианты гена IL12B влияют на подверженность заболеванию у неинфицированных МБТ и инфицированных ранее людей.
Кроме анализа связи генетических маркеров с заболеванием по типу случай-контроль был использован метод оценки ассоциации болезни с генетическими маркерами на семейном материале с помощью Transmission Disequilibrium Test (TDT). Метод оценивает предпочтительность переноса аллеля М1 больному потомку от М1М2 гетерозиготных родителей.
Если аллель М1 переносится существенно больше, чем в половину раз, можно заключить, что маркерный локус сцеплен с локусом предрасположенности к заболеванию, и что аллель М1 положительно ассоциирован с аллелем, который увеличивает восприимчивость к заболеванию, или является таковым [Spielman R.S. et. al., 1993].
Таблица 16 Статистические показатели для сравнения частот аллелей и генотипов полиморфизма 1188А/С гена IL12B у больных различным по генезу туберкулезом и здоровых
Выборка больных ТБ |
Генотипы 1188А/С |
Сравнение |
OR(95%CI) |
p |
|||
генотипов |
аллелей |
||||||
ТБ первичного периода |
АА |
27 |
р=0,012 |
р=0,370 |
0,93(0,42-2,06) |
0,997 |
|
АС |
11 |
0,71(0,30-1,64) |
0,500 |
||||
СС |
4 |
13,47(1,35-326,42) |
0,013 |
||||
ТБ вторичного периода |
АА |
135 |
р=0,041 |
р=0,041 |
0,69(0,43-1,10) |
0,120 |
|
АС |
89 |
1,20(0,75-1,94) |
0,491 |
||||
СС |
13 |
7,43(1,00-153,87) |
0,023 |
Примечание. Обозначения см. табл. 12
Расчет TDT провели для всех исследованных полиморфных маркеров, за исключением D543N гена NRAMP1, для которого TDT не был рссчитан из-за низкой гетерозиготности родителей пробандов (табл. 17). Анализ показал наличие связи полиморфизма 1188А/С гена IL12B с туберкулезом. Дети, больные туберкулезом, лишь в 13% случаев наследовали от родителей аллель 1188А, тогда как аллель 1188С - в 87%.
Таблица 17 Число аллелей, унаследованных больными потомками от гетерозиготных родителей
Ген |
Полиморфизм |
Аллели |
Количество перенесенных аллелей |
TDT |
p (d.f.=1) |
|
NRAMP1 |
469+14G/C |
G |
10 |
1,00 |
0,317 |
|
С |
6 |
|||||
1465-85G/A |
G |
12 |
0,15 |
0,695 |
||
A |
14 |
|||||
274C/T |
C |
9 |
0,06 |
0,808 |
||
T |
8 |
|||||
IL12B |
1188A/C |
A |
2 |
8,07 |
0,005 |
|
C |
13 |
|||||
VDR |
B/b |
B |
6 |
2,00 |
0,157 |
|
b |
12 |
|||||
F/f |
F |
11 |
0,00 |
1,000 |
||
f |
11 |
|||||
IL1B |
+3953A1/A2 |
A1 |
9 |
0,05 |
0,818 |
|
|
A2 |
10 |
||||
IL1RN |
VNTR |
A1 |
9 |
0,60 |
0,439 |
|
не А1* |
6 |
Примечание. р - достигнутый уровень значимости; d.f. - число степеней свободы; * - аллели А2 и А3
Найденная связь изменчивости гена IL12B закономерна, поскольку продукт экспрессии этого гена - IL-12 является ключевым цитокином для усиления клеточно-опосредованного иммунного ответа и инициации эффективной противоинфекционной защиты. Он секретируется макрофагами в ответ на индукцию микробными компонентами и продуктами, активирует дифференцировку Т-лимфоцитов, повышает их цитотоксическую активность, усиливает пролиферацию естественных киллеров, Т-лимфоцитов и продукцию других цитокинов. Главный эффект - индукция синтеза INF-г. Характер течения и исход многих инфекций зависят от способности возбудителя индуцировать синтез IL-12 [Тотолян А.А., Фрейдлин И.С., 2000]. Таким образом, у русских жителей г. Томска установлена ассоциация полиморфизма 1188А/С гена IL12B с заболеванием: индивиды-носители аллеля 1188С в большей степени подвержены туберкулезу, как первичному, так и вторичному. Важным обстоятельством с точки зрения достоверности является тот факт, что показанная связь маркера с заболеванием выявлена как методом случай - контороль, так и TDT на семейном материале.
3.3 Анализ накопления случаев туберкулеза в семьях больных
В практической деятельности фтизиатры выделяют такое понятие, как семейный контакт по туберкулезу. Оно подразумевает наличие тесного семейного общения родственников и неродственных индивидов с больным туберкулезом. Также выделяют смежное понятие - семейный туберкулез. О таком туберкулезе говорят, когда больны родственники пациента. При сравнении частоты встречаемости родственников, больных туберкулезом, у заболевших этой инфекцией и у здоровых индивидов, были выявлены отличия (ч2=15,67, р<0,001) (табл. 18). Показано, что вероятность заболеть туберкулезом выше у индивидов, в семьях которых имеются лица, перенесшие это заболевание (OR=3,63, 95%CI:1,84-7,31; р<0,000). У больных частота туберкулеза среди родственников первой степени родства в 3,63 раза выше по сравнению с родственниками первой степени родства здоровых индивидов.
Таблица 18 Частота заболевания туберкулезом родственников больных данным инфекционным заболеванием и здоровых индивидов
Выборка |
Нет тубер-кулеза в роду |
Имеют родственников с туберкулезом |
Кол-во родствен-ников 1 степени родства с туб-зом |
Кол-во родствен-ников 2 степени родства с туб-зом |
|||
Из них 1 степени родства |
Из них 2 степени родства |
Из них 1 и 2 степени родства |
|||||
Здоровые n=97 |
84 (86,6%) |
1 (1%) |
11 (11,4%) |
1 (1%) |
2 |
14 |
|
Больные туберкулезом n=225 |
144 (64%) |
59 (26,2%) |
12 (5,3%) |
10 (4,5%) |
93 |
25 |
Примечание. n - численность группы
Необходимо отметить, что учитывались родственники I и II степени родства, перенесшие туберкулез, но не имеющие тесного семейного контакта в период болезни с обследуемыми индивидами. Таким образом, в данном случае туберкулезный контакт, как причину накопления случаев заболевания у родственников индивидов больных ТБ, можно исключить.
К тому же исследование распространенности туберкулеза среди супругов пробандов, не состоящих в кровном родстве с больными туберкулезом, но находившихся с ними в семейном контакте, проведенное В.П. Чукановой с соавт. (1995), показало, что частота туберкулеза легких в этой группе не отличалась от частоты заболевания среди населения обследованной этнической группы. Кроме того, было установлено, что в семьях пробандов, которые болели деструктивными формами инфекции, частота туберкулеза среди родственников первой степени родства превышала в пять раз частоту заболевания среди населения при отсутствии семейного контакта [Чуканова В.П. и др., 1995]. В аналогичном исследовании, проведенном ранее, получены сходные результаты: в роду здоровых туберкулез встречался в пять раз реже, чем у больных [Березовский Б.А. и др., 1986]. Можно заметить, что в исследовании жителей г. Томска увеличение заболеваемости среди родственников больных несколько ниже. Возможно, это обусловлено социальными, демографическими, или другими причинами. Повышение частоты туберкулеза у родственников больных по сравнению со здоровыми, свидетельствует в пользу имеющегося мнения о наследственной предрасположенности к инфекционным заболеваниям, в том числе к туберкулезу.
При дальнейшем анализе выборку больных разделили на две группы: первую группу составили пациенты, родственники которых болели туберкулезом, вторую - те, среди родственников которых не было заболевших этой инфекцией. Учитывались родственники I и II степени родства. При сравнении частот аллелей у больных первой и второй группы установлено, что в выборке больных семейным туберкулезом статистически значимо чаще встречался аллель 543N гена NRAMP1 (ч2=6,08, р=0,014).
Полиморфизм D543N гена NRAMP1 является наиболее исследованным в различных популяциях мира из всех аллельных вариантов этого гена. Показана его значимость в подверженности к туберкулезу у японцев и китайцев [Gao P. S. et al., 2000; Liu W. et al., 2004]. Однако у русских г. Томска не найдено ассоциаций этого полиморфизма с заболеванием. Вероятно, полученное накопление аллеля 543N гена NRAMP1 в группе больных, чьи родственники заболели ТБ, по сравнению с больными, у которых здоровые родственники, можно объяснить неравновесием по сцеплению с другим полиморфизмом этого гена, значимым для туберкулеза.
3.4 Анализ связи полиморфизма генов NRAMP1, IL12B, VDR, IL1B, IL1RN с патогенетически важными параметрами болезни
Учитывая поставленные задачи, поиск ассициаций исследуемых полиморфизмов с патогенетически важными параметрами болезни проведен в два этапа: во-первых, анализировали качественные, патогенетически значимые признаки туберкулеза, во-вторых, проведен анализ связи генов с количественными показателями болезни.
3.4.1 Анализ ассоциаций исследованных генов с качественными признаками туберкулеза
Патоморфологические изменения в органах и тканях при туберкулезе многообразны, обусловлены биологическими закономерностями воспалительной реакции, а также особенностями возбудителя болезни, зависят от формы, стадии, локализации и распространенности патологического процесса. Туберкулез относят к хроническим гранулематозным заболеваниям, для которых характерно одинаковое построение гранулем, состоящих из эпителиоидных клеток, гигантских клеток Пирогова-Лангханса и лимфоцитов [Струков А.И., Кауфман О.Я., 1989]. В основе воспаления лежат фазы экссудации, альтерации и пролиферации, однако они не всегда четко выражены и не всегда сохраняется их последовательность. Туберкулезные бугорки могут быть экссудативными (преимущественно лимфоцитарные), продуктивными (эпителиоидно-гигантоклеточные), некротическими, что зависит от вирулентности МБТ, а также от особенностей иммунной реактивности инфицированного макроорганизма [Пузик В.И. и др., 1973; Ерохин В.В., Земскова З.С., 2003]. Степень выраженности различных фаз воспаления также зависит от характера ткани, в которой развивается патологический процесс. Так, экссудация и альтерация будут более резко выражены в рыхлых тканях, и менее - в плотных [Хоменко А.Г., 1996].
Для оценки влияния вариантов генов NRAMP1, VDR, IL1B, IL12B, IL1RN на изменчивость признаков болезни, определяемых рентгенологическими методами, проведен поиск ассоциаций генетических маркеров с наличием деструкции в легочной ткани при туберкулезе и с объемом поражения легкого. При этом пользовались определенным алгоритмом сравнения (рис. 5).
Рис. 5 Алгоритм сравнения групп больных туберкулезом и здоровых индивидов
Выборка больных вторичными формами туберкулеза легких была разделена на две группы в зависимости от наличия деструкции легочной ткани: первую составили 184 больных с экссудативно-некротическим и пролиферативно-некротическим типом воспалительной реакции (инфильтративный туберкулез в фазе распада, диссеминированный туберкулез в фазе распада, казеозная пневмония, фиброзно-кавернозный туберкулез легких); во вторую отнесены 52 больных туберкулезом с отсутствием некроза ткани легкого (диссеминированный туберкулез легких в фазе инфильтрации, инфильтративный туберкулез без распада, очаговый туберкулез, туберкулома).
При сравнении распределений генотипов и частот аллелей исследуемых полиморфизмов в этих группах выявлены статистически значимые отличия.
Так, частота аллелей и генотипов полиморфизма 469+14G/C гена NRAMP1 в выборке больных с экссудативно-некротическим и пролиферативно-некротическим типом воспалительной реакции отличалась от соответствующих значений, у больных с пролиферативным и экссудативным типом воспалительной реакции: у больных деструктивным туберкулезом легких частота аллеля 469+14C была выше (табл. 19).
Таблица 19 Частота аллелей и генотипов полиморфизма 469+14G/C гена NRAMP1 у больных туберкулезом с различным типом воспалительной реакции ткани легкого
Группы больных туберкулезом |
Гено-типы |
N |
Сравнение генотипов р |
Аллели |
Сравнение аллелей р |
|
Больные туберкулезом с деструкцией легочной ткани |
GG GC CC |
108 60 5 |
0,048 |
G=0,798 |
0,027 |
|
Больные туберкулезом без деструкции легочной ткани |
GG GC CC |
39 8 1 |
G=0,896 |
Примечание. N - численность генотипов; р - достигнутый уровень значимости
Ассоциация 469+14G/C полиморфизма NRAMP1 гена, возможно, обусловлена функциональной значимостью белкового продукта гена. Белок, NRAMP1 участвует в процессе фагоцитоза и таким образом обеспечивает защиту организма от внутриклеточных микробных агентов. Вероятно, 469+14C аллель снижает функциональную активность NRAMP1, влияя на течение возникшего заболевания и обусловливая развитие деструктивных процессов при вторичном туберкулезе легких. Показано, что у японцев формирование деструкции при туберкулезе также связано с изменчивостью гена NRAMP1, ассоциацию проявил полиморфизм D543N [Abe T. et al., 2003].
При сравнении больных туберкулезом с деструкцией и без таковой со здоровыми, выявлены ассоциации аллеля 274T гена NRAMP1, +3953А2 гена IL1B, 1188С гена IL12B и аллеля А2 VNTR полиморфизма гена IL1RN с распадом ткани легкого (табл. 20). Полиморфные варианты IL1B и IL1RN регулируют эффект IL-1в и таким образом участвуют в моделировании иммунного ответа [Tarlow J.K. et al., 1993]. Обнаружено, что макрофаги больных туберкулезом отличает пониженная способность секретировать ИЛ-1в [Селедцова Г.В. и др., 1991]. Причем при деструктивном процессе наблюдалось более выраженное снижение продукции ИЛ-1, чем при отсутствии некроза легочной ткани [Хонина Н.А. и др., 2000].
Показано, что экспрессия мРНК IL-1в, индуцированная МБТ выше у субьектов IL1В(+3953)А1+ и ниже - у индивидов с IL1В(+3953)А1- гаплотипом. Также известно, что А2 аллель IL1RN приводит к повышению продукции мРНК и секреции белка IL-1RN [Wilkinson R.J. et al., 1999].
Учитывая близкое расположение IL1B и IL1RN на хромосоме 2, предположили, что гены, кодирующие эти белки, наследуются не независимо друг от друга, то есть между локусами имеется неравновесие по сцеплению. С целью подтверждения или опровержения данной гипотезы, между IL1B и IL1RN в выборке больных деструктивным туберкулезом были произведены расчеты неравновесия по сцеплению.
Таблица 20 Статистические показатели для сравнения частот генотипов и аллелей в группах больных туберкулезом с деструкцией и без деструкции ткани легкого со здоровыми индивидами
Поли-морфизм |
Наличие деструкции |
Гено-тип |
N |
Частота аллеля у больных |
Сравнение со здоровыми |
||
генотипов |
аллелей |
||||||
NRAMP1 |
|||||||
274C/T |
+ |
CC CT TT |
96 74 11 |
С=0,735 |
р=0,013 |
р=0,005 |
|
- |
CC CT TT |
29 17 1 |
С=0,798 |
р=0,671 |
р=0,506 |
||
IL1B |
|||||||
+3953 A1/А2 |
+ |
A1A1 A1A2 A2A2 |
100 63 21 |
А1=0,715 |
р=0,022 |
р=0,008 |
|
_ |
A1A1 A1A2 A2A2 |
26 20 1 |
А1=0,766 |
р=0,378 |
р=0,497 |
||
IL12B |
|||||||
1188A/С |
+ |
AA AC CC |
94 67 12 |
А=0,737 |
р=0,012 |
р=0,013 |
|
_ |
AA AC CC |
31 15 1 |
А=0,819 |
р=0,750 |
р=0,986 |
||
IL1RN |
|||||||
VNTR |
+ |
A1A1 A1A2 A2A2 другие |
93 60 20 9 |
А1=0,690 А2=0,283 А3=0,030 |
р=0,056 |
р=0,017 |
|
_ |
A1A1 A1A2 A2A2 другие |
29 18 2 2 |
А1=0,765 А2=0,216 А3=0,020 |
р=0,262 |
р=0,684 |
Примечание. Обозначения см. табл. 19
Показано наличие неравновесия по сцеплению между генами, причем +3953А1 аллель IL1B и А1 аллельVNTR полиморфизма IL1RN оказались в фазе отталкивания, мера неравновесия для них составила -0,033 (р=0,009). Известно, что неравновесие по сцеплению возникает между неаллельными генами, расположенными на одной хромосоме столь близко, что частота кроссинговера приближается к нулю. Также гаметическое неравновесие может наблюдаться между генами, локализованными на разных хромосомах, что является результатом действия факторов популяционной динамики, например, естественного отбора [Животовский Л.А., 1984].
При сравнении частоты гаплотипа IL1RN*A1A1/IL1B*A1A1 в группах больных туберкулезом и здоровых индивидов найдено, что статистически чаще это сочетание встречается в контрольной выборке (ч2=9,10, р=0,003). Причем риск заболеть туберкулезом у носителей этого гаплотипа равен 0,50 (0,31-0,79). Таким образом, у русских жителей г. Томска гаплотип IL1RN*A1A1/IL1B*A1A1 имеет протективный эффект в отношении заболевания туберкулезом.
Для оценки тяжести туберкулезного процесса определяют распространенность патологического образования в пораженном органе. Выборку больных вторичным туберкулезом легких разделили на три группы в зависимости от объема поражения. Первую группу составили 68 больных с ограниченным по протяженности туберкулезным процессом (1-2 сегмента). Во вторую группу вошли 37 пациентов, у которых туберкулез локализовался в пределах одной доли. Третью группу составили 115 больных с распространенной формой заболевания (объем поражения - больше доли).
При сравнении этих групп найдены ассоциации генетических маркеров с распространенностью специфического процесса при туберкулезе (табл. 21). В группе больных ТБ с объемом поражения ткани легкого более доли статистически значимо чаще, чем в выборке пациентов с туберкулезом с поражением легкого менее доли, регистрировали индивидов, обладающих гомозиготным по аллелею 469+14С гена NRAMP1 и гетерозиготным генотипом (р=0,043). Таким образом, можно говорить о вкладе 469+14С аллеля гена NRAMP1 не только в формирование деструкции при туберкулезе, но и в увеличение зоны поражения. Хотя полиморфизм 469+14G/С гена NRAMP1 не проявил связь с туберкулезом, его "мутантный" аллель негативно влиял на течение возникшего заболевания, обусловливая распад ткани легкого и увеличивая объем поражения. Противоположным действием на течение туберкулезного процесса обладал полиморфизм B/b гена VDR. Аллель b этого маркера ассоциирован с ограниченным по распространенности вторичным туберкулезом (р=0,021).
Кроме того, с объемом поражения ткани легкого при вторичном туберкулезе проявили ассоциацию полиморфизмы +3953А1/А2 IL1B, 1188А/С IL12B и полиморфизм VNTR IL1RN. Различалась частота генотипов и аллелей в группе контроля и в группах больных туберкулезом разным по площади поражения ткани легкого (табл. 22).
Таблица 21 Частота аллелей и генотипов в группах больных туберкулезом с разным объемом поражения легочной ткани
Полиморфизм |
Генотипы |
N (%) |
Объем поражения легкого* |
Более доли |
Доля |
Менее доли |
|
NRAMP1 |
|||||||
469+14 G/C |
GG GC CC |
60 (56,6) 41 (38,7) 5 (4,7) |
Более доли |
- |
р=0,016 |
||
GG GC CC |
26 (70,3) 11 (29,7) 0 (0) |
Доля |
р=0,043 |
- |
р=0,875 |
||
GG GC CC |
47 (72,3) 17 (26,2) 1 (1,5) |
Менее доли |
р=0,707 |
- |
|||
VDR |
|||||||
B/b |
BB Bb bb |
22 (20) 63 (57,3) 25 (22,7) |
Более доли |
- |
р=0,895 |
р=0,021 |
|
BB Bb bb |
7 (18,9) 22 (59,5) 8 (21,6) |
Доля |
р=0,973 |
- |
|||
BB Bb bb |
3 (4,4) 44 (64,7) 21 (30,9) |
Менее доли |
р=0,011 |
- |
Примечание. Обозначения см. табл. 19; * - над диагональю показан уровень р для сравнения частот аллелей, под диагональю - уровень р для сравнения частот генотипов
Таблица 22 Частоты генотипов и аллелей в выборках больных туберкулезом с разным объемом поражения ткани легкого в сравнении с контрольной группой
Ген |
Поли-морфизм |
Объем поражения легкого |
Частота у больных |
Сравнение со здоровыми |
||||
генотипы |
N |
аллели |
генотипы |
аллели |
||||
NRAMP1 |
274C/T |
Более доли |
CC CT TT |
54 51 8 |
С=0,704 |
р=0,002 |
р=0,001 |
|
IL1B |
+3953 A1/А2 |
Менее доли |
A1A1 A1A2 A2A2 |
35 25 8 |
А1=0,699 |
р=0,038 |
р=0,015 |
|
IL12B |
1188 A/С |
Более доли |
AA AC CC |
61 37 8 |
А=0,750 |
р=0,022 |
р=0,058 |
|
IL1RN |
VNTR |
Более доли |
A1A1 A1A2 A2A2 другие |
59 37 13 6 |
А1=0,687 А2=0,287 А3=0,026 |
р=0,057 |
р=0,018 |
Примечание. Обозначения см. табл. 19
Найденная связь 274С/Т гена NRAMP1 представляется закономерной, поскольку этот полиморфизм также показал ассоциацию с деструктивным туберкулезом, а процессы некроза ткани и распространения воспаления взаимосвязаны. Обнаружена ассоциация генотипа 1188С/С IL12B с распространенным туберкулезным процессом. К тому же, учитывая результаты, полученные при сравнении общей группы больных туберкулезом и здоровых, а также данные анализа семейной выборки, можно суммировать, что у индивидов - обладателей генотипа 1188С/С IL12B предрасположенность к туберкулезу выше, чем у обладателей генотипов 1188А/А и 1188А/С, причем носители генотипа 1188С/С в большей степени рискуют заболеть тяжелым распространенным туберкулезом с деструкцией легочной ткани.
Несмотря на то, что биологические эффекты IL-1в и IL-1RN разнонаправленные, показано, что аллель +3953 А2 IL1В и аллель А2 VNTR полиморфизма IL1RN предрасполагают к возникновению распада легочной ткани при туберкулезе. Однако, что касается распространенности туберкулезного поражения, то аллель +3953 А2 IL1В ассоциирован с небольшой (1-2 сегмента) зоной воспаления, а аллель А2 VNTR полиморфизма IL1RN, напротив, с распространенным процессом.
Таким образом, полиморфизмы 469+14G/C гена NRAMP1 и B/b гена VDR оказывают влияние на течение возникшего заболевания. Изменчивость 274С/Т гена NRAMP1, 1188А/С IL12B, +3953А1/А2 IL1B и VNTR IL1RN предрасполагают к возникновению ТБ, причем все перечисленные маркеры кроме изученного полиморфизма гена IL1B способствуют заболеванию распространенным деструктивным туберкулезом. Полиморфизм +3953А1/А2 гена IL1B обусловливает подверженность к ограниченному туберкулезу с деструкцией ткани легкого у русских г. Томска.
При изучении ассоциаций с патогенетически важными для ТБ качественными признаками у тувинцев выявлена связь генетических маркеров с деструктивным процессом в легком.
Ассоциированными с распадом ткани легкого при туберкулезе оказались полиморфизм B/b гена VDR и полиморфизм VNTR гена IL1RN [Рудко А.А., 2004]. При сравнении найденных у тувинцев и русских ассоциаций можно отметить, что в обеих группах показана связь полиморфизма VNTR (аллеля А2) гена IL1RN с деструкцией при туберкулезе.
Наряду со сходством показаны и отличия. У русских г. Томска этот полиморфизм оказывал влияние на уровне предрасположенности к ТБ, тогда как у тувинцев обусловливал различное клиническое проявление возникшего заболевания. Как у русских, так и у тувинцев найдено влияние полиморфизма B/b гена VDR на течение туберкулезной инфекции. В выборке жителей г. Томска аллель b был ответственен за небольшой объем поражения легкого, а у тувинцев - за отсутствие деструкции при ТБ.
3.4.2 Анализ ассоциаций исследованных генов с количественными признаками туберкулеза
Туберкулез характеризуется специфическими проявлениями признаков, многие из которых имеют не качественную, а количественную природу. В связи с этим, одним из важных аспектов изучения генетических основ туберкулеза представляется анализ наследственной составляющей количественных признаков, существенных в патогенезе заболевания. С целью оценки влияния полиморфизма генов NRAMP1, VDR, IL1B, IL12B, IL1RN на течение туберкулезного процесса проведен поиск ассоциаций изучаемых маркеров с количественными, патогенетически важными признаками туберкулеза.
В эту часть исследования включили группу больных вторичным туберкулезом легких (181 человек), которую на 91% (165 человек) составили пациенты с распространенным туберкулезом, остальным был выставлен диагноз очагового туберкулеза легких и туберкулемы. Для остальных пациентов с вторичным ТБ показатели общего анализа крови на момент начала заболевания оказались недоступны.
Оценивали влияние изученных полиморфизмов на показатели крови при туберкулезе легких: гемоглобин, эритроциты, лейкоциты, скорость оседания эритроцитов (СОЭ), уровень палочкоядерных и сегментоядерных нейтрофилов, эозинофилов, лимфоцитов и моноцитов. Известно, что некоторые параметры крови зависят от пола и возраста индивида. Так, у русских г. Томска, больных туберкулезом показана зависимость от пола и возраста для лейкоцитов, СОЭ и моноцитов. В связи с этим перечисленные показатели анализировали отдельно в группе мужчин и женщин, к тому же вводилась поправка на возраст. Учитывая статистически значимые отклонения распределений большинства исследованных признаков от закона Гаусса по данным теста Колмогорова-Смирнова, сравнение проводилось с помощью непараметрических критериев Краскела-Уоллиса и Манна-Уитни [Гланц С., 1998].
Подобные документы
Ферментативная система биотрансформации ксенобиотиков. Полиморфизм генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков и патология. Анализ роли полиморфных вариантов генов ферментов метаболизма ксенобиотиков в детерминации бронхиальной астмы и туберкулеза.
диссертация [245,8 K], добавлен 15.01.2009Признаки легочной лихорадки в египетских папирусах, произведениях древнейших китайских ученых и священных книгах индусов. Степень влияния наследственных факторов на возникновение и течение болезни. Врожденная относительная резистентность к туберкулезу.
реферат [18,8 K], добавлен 21.04.2009Роль иммунитета в патогенезе туберкулеза. Аэрогенный и алиментарный пути проникновения патогена. Взаимосвязь полиморфизма гена МВР с чувствительностью к легочному туберкулезу, резистентность к заболеванию. Роль цитокина в противотуберкулезной защите.
реферат [96,2 K], добавлен 21.04.2009Рассмотрение многообразия клинических проявлений и форм туберкулеза. Этапы диагностики туберкулеза, правила сбора мокроты, рентгенологические проявления туберкулеза органов дыхания. Культуральные и молекулярно-генетические методы выявления возбудителя.
презентация [933,0 K], добавлен 13.04.2015Осуществление рутинных методик полимеразно-цепной реакции (ПЦР). ПЦР диагностика туберкулеза легких. Молекулярно-генетическое исследование для идентификации видов микобактерий из культурального материала. ПЦР диагностика внелегочных форм туберкулеза.
курсовая работа [1,2 M], добавлен 20.05.2013Методы диагностики туберкулеза легких. Роль метода полимеразно-цепной реакции в дифференциальной диагностике различных заболеваний органов дыхания. Молекулярно-генетическое исследование для идентификации видов микобактерий из культурального материала.
дипломная работа [532,6 K], добавлен 28.05.2013Молекулярные и диагностика основы наследственных болезней. Симптоматическое, патогенетическое и этиологическое лечение хромосомных болезней. Коррекция генетического дефекта при моногенных заболеваниях. Подавление избыточной функции генов и их продуктов.
презентация [914,0 K], добавлен 10.10.2013Сущность, значение и области применения молекулярно-генетических методов исследования. Специфика метода полимеразной цепной реакции. Блот-гибридизация по Саузерну. Картирование генов и идентификация хромосомных аберраций с помощью "FISH"-метода.
презентация [971,4 K], добавлен 07.12.2014Геномика и медицина. Структура вирусного генома. Другие геномы. Структура генома прокариот. Ориентация генов (направление транскрипции). Гомологичные гены и копийность генов. Изменение функции гена в процессе эволюции. Исследования генома человека.
курсовая работа [2,2 M], добавлен 04.01.2008Роль метода полимеразно-цепной реакции в дифференциальной диагностике различных заболеваний органов дыхания. Молекулярно-генетическое исследование для определения устойчивости комплекса Mycobacterium tuberculosis к противотуберкулезным препаратам.
дипломная работа [1,3 M], добавлен 13.06.2013