Разработка программного обеспечения для анализа и моделирования взвешенных сетей
Пример матрицы смежности для соответствующей сети. Функция распределения степеней узлов. Вариант матрицы смежности для взвешенной сети. Распределение степеней для случайных графов. Требования к интерфейсу. Алгоритм модели Баррат-Бартелэмью-Веспиньяни.
Рубрика | Программирование, компьютеры и кибернетика |
Вид | контрольная работа |
Язык | русский |
Дата добавления | 13.06.2012 |
Размер файла | 1,4 M |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
Введение
Активно развивающаяся в последнее время теория сложных сетей позволяет понять и количественно характеризовать многие свойства окружающего нас мира. К сложным сетям относятся сети социальных и экономических связей, сети трафика транспорта, энергии, информации и многое другое. Основная цель изучения сетей - разработка алгоритмов для управления, оптимизации и предсказания процессов в сетях.
Однако, как давно было признано, многие сети являются существенно взвешенными, их ребра имеют различную силу. В социальных сетях между людьми могут быть более сильные или более слабые социальные связи. В сети метаболизма может быть больший или меньший поток вдоль частных путей реакции. В пищевых сетях может быть больший или меньший энергетический или углеродный поток между парами жертва-хищника. Весам ребер в сетях уделяется в физической литературе относительно небольшое внимание по той исключительной причине, что в любой области рекомендуется рассмотреть сначала простые случаи (невзвешенные сети) и только потом перейти к более сложным (взвешенные сети). С другой стороны, есть много случаев, когда веса ребер сети известны, и игнорировать их - значит отбросить много данных, которые, по меньшей мере теоретически, могли бы помочь нам лучше понять эти системы.
Данная работа посвящена разработке программного обеспечения для анализа и моделирования взвешенных сетей.
1. Теоретико-аналитическая часть
Взвешенная сеть представляет собой сеть, где связи между узлами имеют веса, привязанные к ним. Сеть представляет собой систему, элементы которой так или иначе связаны. Элементы системы представлены в виде узлов (вершин) и связей (ребер) между ними. Узлы могут быть нейронами, индивидами, группами, организациями, аэропортами или даже странами, тогда как связь может осуществляться в форме дружбы, общения, сотрудничества, союза, поток или торговли.
В ряде реальных сетей не все связи в сети имеют одинаковую мощность. На самом деле, связи часто ассоциируются с весами, которые отличают их по своей силе, интенсивности или мощности. С одной стороны, сила социальных отношений в социальных сетях - это показатель их продолжительности, эмоциональной напряженности, интимности и обмена услугами. С другой стороны, для несоциальных сетей, вес часто ссылается на функцию, выполняемую связью, например, поток углерода между видами в пищевых цепях, количество синапсов в нейронных сетях или объем трафика, проходящего по связям в транспортных сетях.
1.1 Основные характеристики
Степень узла. В современной теории сетей число связей узла называется степенью (degree). Как видно из рисунка 1, узел A имеет степень пять, остальные узлы - степень три. Понятие степень является локальной характеристикой графа [1].
Рис. 1. Невзвешенный граф
Матрица смежности. Сетевые структуры можно описывать в матричной форме. Сеть из N узлов описывается квадратной матрицей смежности a размерности , в которой ненулевые элементы матрицы обозначают наличие связей между соответствующими узлами. Для неориентированных сетей недиагональный элемент матрицы смежности равен числу связей между узлами i и j, и, следовательно, матрица для такой сети симметрична. Предполагается, что петли единичной длины и кратные связи запрещены, следовательно, значения диагональных элементов равны нулю [1].
На рисунке 2 показан пример матрицы смежности для соответствующей сети.
Рис. 2. Матрица смежности
Распределение степеней. Функция распределения степеней узлов P(k) - вероятность того, что узел i имеет степень ki = k [2].
. (1)
Кластеризация. Кластеризация - это локальная характеристика сети. Она характеризует степень взаимодействия между собой ближайших соседей данного узла. В большинстве сетей, если узел А соединен с узлом В, а узел В-с узлом С, то существует большая вероятность, что узел А соединен с узлом С (друзья наших друзей обычно также являются и нашими друзьями).
Коэффициент кластеризации данного узла есть вероятность того, что два ближайших соседа этого узла сами есть ближайшие соседи. Другими словами, если узел j имеет ближайших соседей с числом связей между ними, то локальный коэффициент кластеризации равен:
. (2)
Число есть суммарное число треугольников - циклов длины 3 - прикрепленных к узлу j, а - максимально возможное число треугольников. Если все ближайшие соседи узла j взаимосвязаны, то . Когда между ними нет связей (как у деревьев), то .
Кластеризация всей сети определяется как:
, (3)
где - число треугольников в сети, а - число связанных триад, где «связанная триада» означает узел и два его ближайших соседа [1].
Рис. 3. Кластеризация
На рисунке 3 показан пример кластеризации. Данная сеть состоит из одного треугольника и восьми «вилок», (под «вилкой» понимают вершину с двумя ребрами), поэтому коэффициент кластеризации для заданной сети будет равен:
. (4)
Вес ребра. Это значение, поставленное в соответствие данному ребру взвешенной сети. Сумма весов всех связей узла i называется силой этого узла.
Матрица весов. Вариант матрицы смежности для взвешенной сети, представляет собой квадратную матрицу a размерности (N - число вершин), элемент которой равен весу ребра , если таковое имеется в сети; в противном случае элемент полагается равным нулю или бесконечности в зависимости от решаемой задачи. На рисунке 4 показан пример матрицы весов для соответствующей сети.
Рис. 4. Матрица весов
1.2 Основные модели, описывающие поведение сетей
Модель случайных графов Эрдеша - Реньи. В 1959 г. Эрдеш и Реньи предложили математическую теорию случайных графов. Процесс построения сети Эрдеша и Реньи можно описать в терминах «орел и решка»: имеется конечное число узлов, выбирается два узла, если выпадает орел, узлы связываются между собой; в случае решки эти два узла не соединяются; далее случайно выбирается другая пара вершин, и процесс повторяется (или в более общем случае случайно выбранная пара вершин сети с вероятностью соединяется, а вероятностью не соединяется, где ). Авторы рассматривали сети с достаточно большим числом вершин и показали, что топология сети описывается биномиальным распределением.
До работ Эрдеша и Реньи теория графов концентрировалась исключительно на малых и регулярных графах, которые не содержали неопределенностей в структуре. Но при исследованиях таких сложных систем, как Интернет или клетка, регулярные графы становятся скорее исключением, чем нормой. Эрдеш и Реньи впервые показали, что большие случайные графы очень «усложнены» и в принципе могут быть описаны с помощью теории вероятностей.
В 1982 г. один из учеников Эрдеша - Б. Боллобас, профессор математики в Университете Мемфиса в США и в Колледже Троицы в Великобритании, рассматривал случайные сети с бесконечным числом вершин и описал форму распределения степеней (вероятность того, что случайным образом выбранная вершина имеет k ребер). Он показал, что распределение степеней для такой сети описывается распределением Пуассона. Распределение Пуассона имеет характерный максимум, указывающий на то, что узлы сети в среднем имеют примерно одинаковое число связей. По обе стороны пика распределение быстро спадает, отклоняясь достаточно мало от среднего значения.
Модель сети с предпочтительным присоединением. В 1999 г. Барабаси и Альберт предложили модель растущей сети, основанную на двух принципах:
1) рост: начинаем с небольшого числа () вершин, на каждом временном шаге к сети добавляется новая вершина, которая связывается ( ) ребрами с уже существующими в системе вершинами;
Рис. 5. Распределение степеней для случайных графов. N = 1000, p = 0.5
2) предпочтительное присоединение: вероятность того, что новая вершина окажется связанной ребром с вершиной пропорциональна ее степени:
(5)
С помощью этой модели, объединяющей рост и предпочтительное присоединение, удалось генерировать сеть с масштабно-инвариантным распределением степеней. Но, к сожалению, масштабно-инвариантная модель не могла в полной мере воспроизвести реальные сети. Хотя она порождала сеть со степенным распределением степеней , значение показателя степени в ней оказывалось фиксированным - , в то время как для сетей реального мира значение находится в интервале от 2 до 3. Многие эффекты, а именно: появление новых случайных связей, исчезновение узлов и связей и пересвязывание, в этой модели были для простоты проигнорированы. Тем не менее, масштабно-инвариантная модель вызвала огромный интерес и в дальнейшем были предложены различные ее модификации.
Рис. 6. Модель предпочтительного присоединения
Модель взвешенного предпочтительного присоединения. Модель роста взвешенных сетей, которая объединяет добавление новых ребер и вершин и динамическое изменение весов. Модель основана на простой динамике весов и создает сеть, представляющую статистические свойства, которые наблюдаются в нескольких реальных системах. В частности, модель дает нетривиальную эволюцию во времени свойств вершин и масштабно-инвариантное поведение распределений весов, сил и степеней [3]. Модель была предложена А. Барратом, М. Бартелэмью и А. Веспиньяни (BBV).
Присоединение новых вершин совершается согласно распределению вероятностей:
(6)
где - сила узла. Добавление новых узлов приводит к перераспределению весов в сети по определенному правилу. На рисунке 7 показано это правило.
Рис. 7. Перераспределение весов
Взвешенное присоединение - подходящий механизм для многих технологических сетей. В Интернете, новые маршрутизаторы подключаются к лучшим маршрутизаторам с точки зрения пропускной способности и возможности обработки передачи данных, а в сетях аэропортов новые соединения, как правило, устанавливаются с аэропортами с большими пассажирскими потоками [3].
Модель взвешенного группового предпочтительного присоединения. Баррат и соавторы реализовали модель, которая учитывает сочетание изменение во времени топологии и весов, и которая, возможно, самая простая в классе взвешенных растущих сетей. Новизна в модели - динамическое изменение весов, возникающей при добавлении в сеть новых вершин и ребер. Этот простой механизм создает широкий спектр сложного и масштабно-инвариантного поведения [4].
На основе модели BBV предлагается модель взвешенного группового предпочтительного присоединения (WGP).
В этой модели развитие динамики весов, возникающей при добавлении в сеть новых ребер и вершин и, особенно, выбор нового узла для присоединения происходит согласно механизму группового предпочтения, а именно: для каждого нового узла, выбор целевых узлов происходит в соответствии с их общим весом, а не каждого узла отдельно [4]. На рисунке 8 показан пример работы модели.
Рис. 8. Иллюстрация модели WGP
2. Проектирование и реализация
Сложные сети реального мира содержат множество узлов и ребер. Для их моделирования и анализа необходимо специальное программное обеспечение. Для пользователя важно, чтобы приложение обладало определенным набором функций. Таким образом, можно выделить основные требования к системе.
2.1 Общие требования к интерфейсу
Пользовательский интерфейс представляет собой совокупность методов и средств, при помощи которых пользователь взаимодействует с множеством элементов системы. Требования к пользовательскому интерфейсу можно разбить на две группы:
1. Требования к внешнему виду и формам взаимодействия с пользователем;
2. Требования по доступу к внутренней функциональности системы при помощи пользовательского интерфейса.
К системе должно прилагаться руководство пользования - документ, предоставляющий помощь в использовании системы.
Пользовательский интерфейс должен быть интуитивно понятным. Под этим подразумевается, что пользователь обращается к руководству не чаще, чем раз в десять минуть на этапе обучения и что доступ к любой функции системы осуществляется не более чем за пять щелчков мыши.
2.2 Функциональные требования
Приложение должно иметь возможности:
1. генерировать сети;
2. вычислять основные характеристики:
2.1. распределение степеней;
2.2. коэффициент кластеризации;
2.3. распределение сил узлов;
3. строить графики зависимостей основных характеристик;
4. сохранять и загружать смоделированные сети;
5. сохранять результаты анализа сетей.
2.3 Выбор среды разработки
Для разработки был выбран объектно-ориентированный язык C#. Используемый в нем механизм наследования позволяет описывать классы на основе уже существующего (родительского), при этом свойства и функциональность родительского класса заимствуются новым классом. Это позволяет структурировать объекты системы, тем самым облегчая доступ к полям и функциям наследуемых объектов.
Язык C# содержит богатый инструментарий для создания многофункционального пользовательского интерфейса, поэтому, в настоящее время, широко используется в разработке оконных приложений.
Выбранная среда разработки накладывает следующие требования к ЭВМ:
1. Операционная система Windows XP или более поздняя версия;
2. Для работы приложения необходима установленная программная платформа.NET Framework версии 3.5 или выше.
Структура приложения
Рис. 9. Контекстная диаграмма
Разрабатываемое приложение позволяет моделировать взвешенные и невзвешенные сети, а также дает возможность проводить их анализ. Для этого пользователю нужно ввести необходимые параметры, которые зависят от выбранной модели. Моделирование проводится по 4 алгоритмам:
1. алгоритм модели Эрдеша-Реньи:
1) в начальный момент времени в сети изолированных вершин;
2) с некоторой вероятностью вершины сети связываются между собой.
2. алгоритм модели Альберта-Барабаси:
1) в начальный момент времени в сети изолированных вершин, ;
2) на каждом шаге добавляется новый узел t с m ребрами, ;
3) новая вершина связывается с уже существующими с вероятностью, пропорциональной числу связей узлов в сети:
(7)
матрица смежность программный веспиньяни
Алгоритм модели BBV (Баррат-Бартелэмью-Веспиньяни)
В начальный момент времени в сети связанных вершин, каждая связь имеет начальный вес ;
На каждом шаге добавляется новый узел t с m ребрами, который присоединяется к существующей вершине i, согласно механизму группового предпочтения:
(8)
где - сила узла;
1) появление нового ребра вносит изменения в веса всей сети. Перераспределение весов между узлами совершается по определенному правилу,
(9)
где и [4].
Алгоритм модели взвешенного предпочтительного присоединения:
1) в начальный момент времени в сети связанных вершин, каждая связь имеет начальный вес ;
2) на каждом шаге добавляется новый узел t с m ребрами, который присоединяется к существующим m вершинам, согласно распределению вероятности:
(10)
где - сила узла;
3) появление нового ребра вносит изменения в веса всей сети. Перераспределение весов между узлами совершается по определенному правилу,
(11)
где и [4].
Смоделированную сеть можно сохранить в текстовый файл в виде списка вершин и их соседей. В дальнейшем, сохраненные сети можно загрузить в приложение для анализа.
Анализируются основные характеристики: распределение степеней, распределение весов, кластеризация. Полученные данные также можно сохранить в виде списка и визуализировать. Для распределений степеней и весов графики строятся по логарифмической шкале.
Особенностью приложения является его открытость. Это означает, что оно имеет возможность добавления новых моделей, характеристик для расчета и модулей.
На рисунке 10 показана детализация работы приложения.
Рис. 10. Детализация работы системы
Главное окно программы содержит строку меню, прижатую к верхней части окна, и рабочую область (см. рис. 11). В рабочей области представлены выбор моделей, поля для ввода параметров, а также кнопки для визуализации интересующих величин.
Строка меню содержит 3 пункта: «Файл», «Модули» и «Справка». Пункт «Файл» дает доступ к функциям сохранения и загрузки (см. рис. 12).
Рис. 11. Главное окно приложения
Рис. 12. Пункт меню «Файл»
Через пункт «Модули» можно перейти к исследованию эпидемиологических процессов или к определению структуры сообществ (см. рис. 13).
Рис. 13. Пункт меню «Модули»
Пункт меню «Справка» содержит помощь по работе и информацию о программе (см. рис. 14).
Рис. 14. Пункт меню «Справка»
Используя созданное приложение, проведем сравнительный анализ модели взвешенного предпочтительного присоединения и группового предпочтительного присоединения.
Были смоделированы сети с параметрами: , где - начальное количество узлов, - количество новых вершин, - количество новых ребер. На рисунках 15,16 показаны результаты для распределения степеней в моделях BBV и WGP соответственно.
Рис. 15. Распределение степеней для модели BBV
Рис. 16. Распределение степеней для модели WGP
На рисунках 17, 18 показаны распределения весов для моделей BBV и WGP соответственно.
Рис. 17. Распределение весов для модели BBV
Рис. 18. Распределение весов для модели WGP
Заключение
В данной работе были изучены подходы к моделированию и анализу сложных сетей и их основные характеристики. Были определены необходимые требования к функционалу и пользовательскому интерфейсу программного обеспечения для моделирования сетей и расчета основных характеристик.
Результатом работы является приложение для моделирования и анализа взвешенных и невзвешенных сетей. Приложение удовлетворяет всем предъявленным требованиям и протестировано путем моделирования сетей по нескольким моделям. Для них были рассчитаны основные характеристики: распределение степеней, распределение весов, кластеризация и корреляция.
Дальнейшее развитие приложения предполагает добавление новых характеристик, а также дополнительных модулей для анализа взвешенных сетей.
Список литературы
1. И.А. Евин. Введение в теорию сложных сетей.
2. Dorogovtesev S.N., Mendes J.F.F. Evolution of networks. Oxford University Press, Oxford.
3. Alain Barrat, Marc Bartheґlemy and Alessandro Vespignani. Weighted Evolving Networks: Coupling Topology and Weight Dynamics.
4. Jinying Tonga, Zhenzhong Zhanga, Rongrong Dai. Weighted scale-free networks induced by group preferential mechanism.
Размещено на Allbest.ru
Подобные документы
Понятие сетей и связи их компонентов. Характеристики и структура сетей. Основные модели, описывающие поведение сетей. Проектирование и реализация взвешенных сетей: требования к интерфейсу, выбор среды разработки, структура приложения. Анализ результатов.
курсовая работа [1,1 M], добавлен 29.06.2012Проведения анализа существующих генных сетей. Три типа вершин актуальных объектов для поточечной редукции: источники, стоки и проводящие вершины. Существующие методы декомпозиции. Алгоритм "walktrap" на основе случайных блужданий и определения смежности.
курсовая работа [2,6 M], добавлен 28.02.2012Программа формирования матрицы смежности по заданному списку окрестностей вершин ориентированного графа. Формирование динамического списка дуг ориентированного графа по заданному списку окрестностей. Анализ временной и емкостной сложности алгоритма.
курсовая работа [8,1 M], добавлен 07.09.2012Использование понятий из теории графов при разработке сетей и алгоритмов маршрутизации. Построение матрицы смежности и взвешенного ориентировочного графа. Результаты работы алгоритмов Дейкстры и Беллмана-Форда. Протоколы обмена маршрутной информацией.
курсовая работа [334,1 K], добавлен 20.01.2013История возникновения, основные понятия и теоремы теории графов. Способы предоставления графов в компьютере. Матрица смежности, инциденций, списки смежности и массив дуг. Программа определения кратчайшего пути в графах. Язык программирования Delphi.
курсовая работа [823,5 K], добавлен 24.11.2010- Численные расчёты динамики генных сетей на основе редукции графов в рамках синхронной булевой модели
Теория функционирования генных сетей. Разработка алгоритма анализа динамики генной сети с целью выявления всех её стационарных и циклических устойчивых состояний в рамках булевой модели генной сети. Создание программного средства, его реализующего.
курсовая работа [1,4 M], добавлен 28.02.2012 Математические графы, области их применения. Способы раскраски вершин и ребер графов, задачи на их применение. Разработка алгоритма, работающего на основе операций с матрицей смежности. Описание логической структуры программы. Пример зарисовки графа.
курсовая работа [145,5 K], добавлен 27.01.2013Возможности программ моделирования нейронных сетей. Виды нейросетей: персептроны, сети Кохонена, сети радиальных базисных функций. Генетический алгоритм, его применение для оптимизации нейросетей. Система моделирования нейронных сетей Trajan 2.0.
дипломная работа [2,3 M], добавлен 13.10.2015Обеспечение отказоустойчивости компьютерной сети при эксплуатации. Требования к проектируемой сети в плане ее назначения и типа настраиваемых серверов. Алгоритм установки требуемого программного обеспечения и настройка конфигурации компьютерной сети.
курсовая работа [1,9 M], добавлен 11.04.2019Информационное обеспечение, система автоматизированного управления. Классификаторы технико-экономической информации, унифицированные документы. Этапы проектирования информационного обеспечения. Анализ методов и матрицы смежности информационного графа.
реферат [19,0 K], добавлен 29.10.2010