Исследование механизма фотореакции между 3,3’,4,4’-тетракарбоксибензофеноном и гистидином методом ХПЯ 13С

Химически индуцированная поляризация ядер. Исследование механизма фотореакции и структуры короткоживущих радикалов в реакции 3,3’,4,4’-тетракарбоксибензофенона и гистидина. Расчет структур органических радикалов и значений констант СТВ гибридным методом.

Рубрика Химия
Вид курсовая работа
Язык русский
Дата добавления 30.05.2013
Размер файла 1,1 M

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

Размещено на http://www.allbest.ru/

Размещено на http://www.allbest.ru/

Введение

Свободно-радикальные процессы имеют огромное значение для многих областей науки и техники. Эти процессы лежат в основе реакций горения1, химии атмосферы2, различных биохимических циклов3. Учитывая, насколько важными являются эти области актуальными являются исследования, посвященные изучению структуры свободных радикалах и их свойств. Результаты таких исследований помогут открыть подходы к управлению свободно-радикальных процессов.

Одним из прямых и самых информативных способов регистрации и исследования частиц с неспаренными электронами является метод электронного парамагнитного резонанса (ЭПР). Этот метод позволяет получить информацию о магнитно-резонансных параметрах радикалов - g-тензоре и тензоре сверхтонких взаимодействий с ядрами, но имеет достаточно много ограничений. ЭПР позволяет исследовать, в основном, стабильные радикалы или радикалы, стабилизированные в достаточной концентрации в замороженных матрицах. И хотя современные модификации метода, например оптически детектируемый ЭПР4, позволяют исследовать короткоживущие радикалы в растворах в крайне низких концентрациях, эти методы пока что не получили своего применения для исследования систем в водных растворах из-за высоких диэлектрических потерь в полярных растворителях.

Для регистрации короткоживущих радикалов успешно применяют косвенный метод детектирования, основанный на явлении химической поляризации ядер (ХПЯ)5,6. Достоинством этого метода являются высокое спектральное разрешение, характерное для современного ЯМР, возможность отнесения поляризации в спектре ЯМР к определенным магнитным ядрам в молекуле, а также высокая чувствительность, как следствие значительной неравновесной заселенности ядерных состояний. Следует отметить, что ХПЯ формируется в ходе синглет-триплетных переходов за счет магнитных взаимодействий, таких как разница g-факторов радикалов и сверхтонких взаимодействий между неспаренным электроном и магнитными ядрами, благодаря чему интенсивность сигналов ХПЯ конкретного ядра зависит от константы СТВ. Все это открывает путь для определения величины и знака всех констант сверхтонкого взаимодействия с конкретными атомами в короткоживущем радикале. В свою очередь, обладая таким набором данных, можно сделать определенные выводы об электронной структуре короткоживущих промежуточных частиц и различных механизмах реакций, протекающих с их участием.

Целью данной работы было применение метода время разрешенной ХПЯ на природном содержании ядер 13С для исследования механизма фотореакции и структуры короткоживущих радикалов в реакции 3,3',4,4'-тетракарбоксибензофенона (TCBP) и гистидина (His) (см. рис 1.1)

Рис 1.1 Структурные формулы используемых веществ

Обзор литературы

Химически индуцированная поляризация ядер (ХПЯ).

В основе явления ХПЯ лежит спиновая селективность химических реакций с участием свободных радикалов. ХПЯ проявляется в виде неравновесной заселенности ядерных спиновых состояний в диамагнитных продуктах реакции.

Рассмотрим процессы, приводящие к ХПЯ. Пусть в растворе есть молекулы красителя, поглощающего свет и молекулы, которые являются тушителями по отношению к фотовозбужденному красителю. Краситель, поглощая квант света, переходит из основного синглетного состояния S0 в некоторое возбужденное синглетное состояние Si. За счет интеркомбинационной конверсии молекула красителя переходит в триплетное состояние Ti, после чего за счет внутренней конверсии молекула красителя переходит в нижнее по энергии долгоживущее триплетное состояние T1. Затем, в результате диффузионного движения в растворе, происходит встреча возбужденной молекулы с молекулой-партнером, которая тушит триплетное состояние переносом электрона или атома водорода, либо по другому механизму. Процесс тушения протекает с характерной константой скорости kq~107ч1010 М-1с-1, благодаря этому, радикальная пара (РП), образующаяся в ходе этой реакции, сохраняет триплетное спиновое состояние предшественника. Чтобы произошла рекомбинация внутри клетки из молекул растворителя, радикальной паре необходимо перейти из триплетного в синглетное состояние. Как известно, в дипольном приближении этот переход запрещен, но если учесть магнитные взаимодействия в РП, то он разрешен. Если РП находится в сильном магнитном поле, то спиновая часть гамильтониана РП может быть записана следующим образом7:

(1.1)

Где g1,g2 - g-фактора радикалов, в - магнетон Бора, Bz - напряженность внешнего магнитного поля, - z-компоненты операторов спинов электронов, находящихся, соответственно, в первом и во втором радикалах, i,j - нумерация магнитных ядер в первом и во втором радикалах соответственно, - тензор сверхтонкого взаимодействия (СТВ) k-го ядра с n-ым электроном, - z-компонента оператора спина ядра с номером k.

Если быстро флуктуирующую анизотропную часть тензора СТВ вынести в релаксационный оператор, то вместо тензоров остается скалярная величина изотропного сверхтонкого взаимодействия

(1.1')

В сильном магнитном поле за счет зеемановского взаимодействия состояния T+ и T- далеко удалены по энергии от синглетного состояния, в отличие от T0, поэтому конверсия в синглетное состояние из состояния с нулевой проекцией спина на ось z идет настолько быстрее, что вкладом переходов из других состояний можно пренебречь. Рассмотрим матричный элемент T0-S конверсии для конкретных ядерных состояний

(1.2)

Здесь - разность g-факторов радикалов, - конкретные значения проекций ядерных спинов на ось z.

Из выражения (1.2) видно, что скорость синглет-триплетной конверсии зависит от того, в каких именно спиновых состояниях находятся ядра в момент создания радикальной пары. В итоге, это приводит к тому, что в диамагнитных продуктах геминальной рекомбинации будут преобладать определенные спиновые состояния ядер. Для ядер со спином Ѕ Робертом Каптейном было сформулировано следующее правило8, по которому можно определить знак интегральной поляризации ядер:

(1.3)

где = +1 или -1 для триплетного или синглетного предшественника; = +1 или -1 для продуктов геминальной рекомбинации или внеклеточной; g - разность g-факторов радикала, которому принадлежит рассматриваемое k-ое магнитное ядро, и радикала партнера; Ank - изотропная часть константы СТВ с ядром, поляризация которого рассматривается.

Если для некоторого ядра величина положительна, то в диамагнитных продуктах это ядро будет поляризовано таким образом, что заселенность б-состояния будет выше, и в спектре будет наблюдаться усиленная абсорбция. Иначе, будет заселяться в-состояние, и в спектре будет наблюдаться эмиссия.

Было показано6, что для короткоживущих РП величина интеграла для сигнала ЯМР в геминальном спектре ХПЯ прямо пропорциональна величине константы СТВ с соответствующим ядром, причем константа пропорциональности одна и та же для всех ядер одного изотопа в одной молекуле, а для молекулы партнера совпадает по величине и обратна по знаку, как следует из правил Каптейна:

(1.4)

Обычно, исследуют ХПЯ 1Н, что связано, во-первых, с практически 100% содержанием этого изотопа в природной смеси, во-вторых, со сравнительно высоким гиромагнитным отношением. С другой стороны, ХПЯ 13С является более информативным методом для исследования структуры радикалов, но с другой стороны чувствительность спектроскопии ЯМР ядер 13С ниже на несколько порядков. Понижение чувствительности связано, во-первых, с более низкой разностью заселенностей ядерных состояний, вызванной меньшей разницей по энергии, во-вторых, с низким содержанием (1,1%) магнитного изотопа 13С.

Тем не менее, метод ХПЯ 13С успешно применяется для изотопно-меченных соединений - в 2007 году были опубликованы результаты первого исследования короткоживущих радикалов, образующихся из полностью меченного 13С и 15N триптофана, по геминальным спектрам ХПЯ 13С. В качестве недостатков использования полностью меченных соединений следует выделить следующее: высокая стоимость необходимых реагентов, в также высокие значения констант скалярных спин-спиновых взаимодействий между ядрами 13С, что может привести к наложению мультиплетных сигналов от различных ядер.

В данном контексте перспективным является использование реагентов с природным содержанием изотопа 13С.

Экспериментальная часть

ядро тетракарбоксибензофенон гистидин фотореакция

Спектры ХПЯ 13С

Принципиальная схема установки для проведения экспериментов методом ХПЯ с временным разрешением представлена ниже.

Рис 1.. Принципиальная схема установки для экспериментов по получению время разрешенной ХПЯ. 1 - импульсный УФ-лазер, 2 - оптическая ось луча лазера, 3 - собирающая линза, 4 - кварцевая призма для поворота луча, 5 - кварцевый световод в датчике ЯМР, 6 - криомагнит, 7 - образец в кварцевой ампуле, 8-приемо-передающая катушка датчика ЯМР

ЯМР 13С спектры были записаны на приборе Bruker Avance 300, с использованием широкополосного датчика со встроенным цилиндрическим кварцевым световодом. Облучение лазером проводили при помощи импульсного эксимерного XeCl-лазера лазера COMPEX Lamda Physik (=308 нм), мощность одного импульса на выходе 80-140 мДж, длина импульса?10?нс.

В данной работе применялась следующая импульсная последовательность (рис 1.2). В начале на образец действуют последовательностью импульсов, которая подавляет все сигналы в спектре ЯМР 13С. Это делается для того, чтобы, во-первых, исключить больцмановскую намагниченность 13С, во-вторых, подавление позволяет проводить накопление сигнала, повторяя облучение без ожидания возвращения системы в термическое равновесие, которое протекает за сравнительно длительные времена продольной релаксации T1, характерные для ядер углерода. Затем на образец подается лазерный импульс, вслед за которым синхронизовано подается РЧ-импульс по каналу, работающем на резонансной частоте ядер углерода 13С, и производится регистрация спада свободной индукции. Одновременно с импульсом лазера также запускается гетероядерный декаплер на резонансной частоте ядер 1Н, в результате чего в спектре ЯМР?13С не проявляются скалярные спин-спиновые взаимодействия с ядрами 1H. Это, в свою очередь, повышает отношение сигнал/шум в регистрируемых спектрах. Декаплер запускается именно в момент начала регистрации спада свободной индукции, чтобы исключить вклад в интенсивность сигналов ХПЯ за счет ядерного эффекта Оверхаузера.

Рис 1.3 Временная диаграмма эксперимента

Исследуемый раствор помещался в кварцевую ампулу диаметром 10 мм.

Концентрация красителя подбиралась таким образом, чтобы оптическая плотность на длине волны лазерного излучения была порядка единицы (для ампулы диаметром 10 мм это значит, что 90% импульса поглотится раствором). Концентрация тушителя рассчитывалась так, чтобы тушение всех возбужденных молекул красителя происходило за времена много меньшие, чем времена образования поляризации в результате гомогенных процессов, то есть , где - константа тушения, ?концентрация тушителя, - константа скорости рекомбинации в растворе, - концентрация РП, образовавшихся после лазерного импульса.

В данной работе в качестве красителя использовался 3,3',4,4'-тетракарбоксибензофенон (TCBP), в качестве тушителя - L-гистидин (His), в качестве растворителя - D2O, для доведения раствора до необходимого значения pH использовались концентрированные растворы NaOD и DCl в D2O. Эти вещества и растворы были приобретены в Sigma Aldrich и дополнительной очистке не подвергались.

Измерения рН исследуемого раствора проводились pH-метром Мультитест ИПЛ 311, поправок на изотопные эффекты pH в D2O не проводилось.

Квантово-химические расчеты

Расчеты были проведены автором работы с использованием пакета программ Gaussian 09. Расчеты структур органических радикалов, а также значений констант СТВ были проведены гибридным методом B3LYP на базисе 6-31G в модели континуального растворителя. Входные данные для структур были оптимизированы методом MM2 при помощи пакета программ Chem3D.

Результаты и их обсуждение

Геминальные спектры ХПЯ 13С

В работе10 было установлено, что наибольшие значения поляризации ядер атомов водорода в системе гистидин - TCBP наблюдается в диапазоне значений pH=6ч9 (см. рис 2.1), при концентрациях С(TCBP)= 2 мМ и С(His)= 20 мМ. По данным, полученным методом флеш-фотолиза данной системы (см. Приложение 4), в этом диапазоне кислотности среды константа тушения равна = (1.0ч1.8)109 М-1с-1, то есть характерное время кинетики тушения при используемой концентрации тушителя составляет . Это значит, данная система удовлетворяет требованиям, сформулированным в предыдущем разделе данной?работы.

Для исключения наложения сигналов ХПЯ His и TCBP была исследована зависимость химических сдвигов сигналов в спектре ЯМР 13С от pH. Для регистрации спектров гистидина был приготовлен насыщенный раствор His в D2O, спектры ЯМР 13С TCBP при различных значениях pH были ранее получены Наталией Сапрыгиной. Результаты представлены на рисунке 2.1 (полная картина представлена в Приложении 1). По полученным данным был сделан вывод, что наиболее оптимальным является диапазон pH=6.4-6.6, в котором нет пересечений сигналов. Регистрация спектров ХПЯ проводилась для растворов данной системы при pH=6.46.

Рисунок 2.1 Зависимость интенсивности геминальной ХПЯ 1Н, I, для Н4 протона гистидина (кружки) и N-ацетилгистидина (треугольники) от рН водного раствора. Линии - результаты численного описания

Рисунок 2.2 Зависимость химических сдвигов различных сигналов в спектре ЯМР 13С от pH.Открытые символы - сигналы, относящиеся к His, закрытые -- TCBP Линии - результат расчета по уравнению (2.1). Вертикальная линия - значение рН =6.46. Видно, что при этом значении кислотности все сигналы расположены достаточно далеко друг от друга

На рис. 2.3 приведены спектры ЯМР 13С в случае больцмановской заселенности ядерных состояний и в случае ХПЯ. Благодаря преднасыщению в описанной выше импульсной последовательности, в спектре ХПЯ присутствуют только сигналы от тех ядер, которые имеют отличные от нуля константы СТВ в радикалах. Отнесение сигналов сделано на основе сравнения с литературными данными11, а также по результатам титрования методом ЯМР 13С. Интегралы в спектре ХПЯ изображены на рисунке 2.3, численные значения приведены в Приложении 3. Величина интегральной интенсивности сигнала ХПЯ от ядра 13С в карбонильном положении TCBP была отнормирована на 100. Значения погрешностей были получены путем анализа отношения сигнал/шум для разных областей зарегистрированного спектра.

Рис 2.3 Спектр ЯМР 13С раствора TCBP в D2O при pH=7.00. Данные Н. Сапрыгиной

Рис 2.4 Схематичное изображение интегралов в спектре ХПЯ 13С. Площадь кругов пропорциональна значению соответствующего интеграла. Красные круги - интегралы с положительным значением, синие - с отрицательным

Сравнение экспериментальных данных с результатами квантово-химических расчетов

Для ТСВР в водных растворах предполагается образование двух различных радикалов при фотохимических реакциях в водной среде - продукт простого переноса электрона пентаанион TCBP*? (радикал 1 на рис.?2.5), а также кетильный радикал TCBPH* со структурой типа 2 на том же рисунке. Для установления природы интермедиата в данной реакции были проведены квантово-химические расчеты геометрий и констант СТВ для радикалов 1 и 2.

Рис 2.5 Структурные формулы двух различных радикалов TCBP, которые могут существовать в водных растворах

На рисунке 2.6 приведена зависимость 13С ХПЯ для различных ядер от рассчитанных констант СТВ. В обоих случаях можно отметить сильную корреляцию (R2>0.9), но для радикала 1 полученное значение коэффициента корреляции составляет R2=0.90, а для кетильного радикала 2 - R2=0.98. Эти данные позволяет предположить, что больший вклад в развитие поляризации даёт именно радикал TCBPH*, а не радикал 1. То есть, в качестве механизма тушения следует предположить не перенос электрона, а либо перенос атома водорода, либо перенос электрона с последующим протонированием?анион-радикала.

a) б)

Рис 2.6 Сравнение величин интегральной интенсивности сигналов ХПЯ с константами СТВ, рассчитанных квантово-химически а) для анион-радикала TCBP*? (1); б) для кетильного радикала TCBPH* (2). Линии - результат наилучшего расчета по уравнению (1.4)

Выбор между двумя возможными механизмами реакции можно сделать исходя из величины константы скорости тушения. Известно12, что в случае тушения триплетного состояния по механизму переноса электрона в подобных системах константа скорости составляет = 1109 М-1с-1 и выше, а в случае переноса атома водорода - = 1108 М-1с-1 и меньше. В нашем случае, наблюдаемая константа тушения составляет = 1.2109 М-1с-1, то есть тушение происходит со скоростью, характерной для реакции переноса электрона. Следовательно, в исследуемой системе TCBP+His реакция? тушения фотовозбужденного состояния красителя идет как двухстадийный процесс - сначала происходит перенос электрона с His на TCBP, после чего анион-радикал TCBP*? (1) подвергается быстрому протонированию с образованием кетильного радикала TCBPH*?(2).

Выводы

1. На базе ЯМР спектрометра с магнитным полем 7.1 Тл фирмы Bruker собрана экспериментальная установка для регистрации 13С ХПЯ с микросекундным временным?разрешением

2. Были получены спектры ХПЯ 13С продуктов геминальной реакции тушения для системы TCBP+His при pH=6.46

3. Проведены квантово-химические расчеты значений констант СТВ для двух предполагаемых промежуточно образующихся радикалов: анион-радикал TCBP*? и кетильный радикал TCBPH*.

4. Показано, что есть корреляция между интегралами в спектрах ХПЯ и значениями констант СТВ, рассчитанных теоретически для TCBP*? (R2=0.90) и TCBPH* (R2=0.98), что вновь подтверждает, что метод ХПЯ можно успешно использовать для определения знаков и величин констант сверхтонкого взаимодействия.

5. Из анализа полученных данных сделан вывод о том, что в исследуемой системе TCBP+His реакция тушения фотовозбужденного состояния красителя идет как двухстадийный процесс - сначала происходит перенос электрона с His на TCBP, после чего анион-радикал TCBP*? (1) подвергается быстрому протонированию с образованием кетильного радикала TCBPH* (2).

Список литературы

Westbrook, C. K. & Dryer, F. L. Chemical kinetics and modeling of combustion processes. Symposium (International) on Combustion 749-767 (1981).

2. Barbara J. Finlayson-Pitts, J. N. P. Chemistry of the Upper and Lower Atmosphere. 993 (ACADEMIC PRESS: 2000).

3. Sancar, A. Structure and Function of DNA Photolyase and Cryptochrome Blue-Light. Chemical reviews 103, 2203-2237 (2003).

4. В.А.Багрянский, В.И.Боровков, Ю. Н. М. Квантовые биения в радикальных парах. 76, (2007).

5. Morozova, O. B. et al. Time-resolved CIDNP: an NMR way to determine the EPR parameters of elusive radicals. Physical chemistry chemical physics?: PCCP 13, 6619-27 (2011).

6. Кирютин, А. С. et al. Физическая химия. 342-348 (2009).

7. Бучаченко А.Л., Сагдеев Р.З., С. К. М. Магнитные и спиновые эффекты в химических реакциях. 297 (Новосибирск, 1978).

8. R. Kaptein Simple Rules for Chemically Induced Dynamic Nuclear Polarization. Journal of the Chemical Society D 732-733 (1971).

9. Kiryutin, A. S., Morozova, O. B., Kuhn, L. T., Yurkovskaya, A. V & Hore, P. J. 1H and 13C hyperfine coupling constants of the tryptophanyl cation radical in aqueous solution from microsecond time-resolved CIDNP. The journal of physical chemistry. B 111, 11221-7 (2007).

10. Сапрыгина, Н. Н., Морозова, О. Б., Каптейн, Р., Юрковская, А. В. & Сагдеев, А. Р. З. Влияние заряда аминогруппы на фотоиндуцированное окисление гистидина. ДАН, Физическая химия (2013). Статья принята в печать

11. W.Voelter, E. B. and Carbon-13 NMR Spectroscopy. (1986).

12. Tsentalovich, Y. P., Morozova, O. B., Yurkovskaya, A. V, Hore, P. J. & Sagdeev, R. Z. Time-Resolved CIDNP and Laser Flash Photolysis Study of the Photoreactions of N-Acetyl Histidine with 2 , 2 ? -Dipyridyl in Aqueous Solution. 6912-6916 (2000).

13. Morozova, O. B., Korchak, S. E., Sagdeev, R. Z. & Yurkovskaya, A. V Time-resolved chemically induced dynamic nuclear polarization studies of structure and reactivity of methionine radical cations in aqueous solution as a function of pH. The journal of physical chemistry. A 109, 10459-66 (2005).

Приложения

1. Результаты титрования ЯМР 13С растворов TCBP и гистидина. Зависимость химических сдвигов различных сигналов в спектре ЯМР 13С от pH.Открытые символы - сигналы, относящиеся к His, закрытые - TCBP Линии - результат расчета по уравнению (2.1). Вертикальная линия - значение рН = 6.46. Видно, что при этом значении кислотности все сигналы расположены достаточно далеко друг от друга. Овалами обозначены области, в которых происходит перекрывание сигналов. В качестве стандарта в раствор был добавлен ацетон, сигнал метильных групп в молекуле ацетона обозначен звездами.

2. Структуры радикалов TCBP*? и TCBPH*, рассчитанные квантово-химически. Белые шары - атомы водорода, серые - углерода, красные - кислорода.

а) радикал TCBP*?

б) радикал TCBPH*

3. Значения интегралов в геминальном спектре ХПЯ 13С. Значение интеграла для сигнала от карбонильного атома углерода в молекуле TCBP отнормировано на 100.

Отнесение интеграла

Значение интеграла

Расчетные константы СТВ для анион-радикала

Расчетные константы СТВ для кетильного радикала

His a

0±5

His b

0±4

His C4

-24±4

TCBP C5,C5'

-24±3

-13.7

-9.8

TCBP C2,C2'

47±3

22.4

14.0

His C5

-45±4

TCBP C6,С6'

47±4

22.5

13.3

His C2

-74±5

TCBP C1,C1'

-73±5

-28.2

-11.5

TCBP C3,C2'

-38±5

-14.3

-9.8

TCBP C4,C4'

69±4

23.0

18.9

His COOH

0±5

TCBP (C3,C3')COOH

0±5

2.0

1.3

TCBP (C4,C4')COOH

-14±5

-4.9

-3.9

TCBP C=O

100±3

38.1

15.5

4. Данные Н.Сапрыгиной о величинах констант скорости тушения фотовозбужденного состояния красителя в системе TCBP+His при различных значениях pH. Кружки - результаты измерений методом флеш-фотолиза, квадраты - интенсивность ХПЯ 1Н. Интенсивность ХПЯ была отнормирована таки образом, чтобы максимум расчетной кривой ХПЯ совпадал с максимумом расчетной кривой константы скорости тушения. Сплошные кривые - результаты расчетов, аналогичных приведенным в работе13.

Размещено на Allbest.ru


Подобные документы

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.