Создание алгоритма поиска высокоинформативных диагностических признаков заболеваний молочных желез и построение на их основе алгоритма классификации

Формирование обучающей и тестовой выборок данных, полученных с помощью комбинированной термометрии. Выявление влияния физиологических особенностей организма. Разработка алгоритмов нахождения признаков рака молочной железы; классификация пациенток.

Рубрика Медицина
Вид дипломная работа
Язык русский
Дата добавления 22.09.2014
Размер файла 2,1 M

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

7,1

13

-0,4

РТМ

7,0

14

1

6,1

15

0,36

ИК

6,1

16

0,86

ИК

6,0

17

0,69

РТМ

5,9

18

0,9

ИК

5,9

19

-0,9

РТМ

5,5

20

0,7

5,5

21

0,63

ИК

5,4

22

0,9

ИК

5,4

23

-0,65

ИК

5,3

24

1,3

РТМ

5,3

25

-0,5

РТМ

5,1

26

1,05

РТМ

5,0

27

0,9

ИК

4,8

28

-0,34

РТМ

4,6

29

-0,65

РТМ

4,5

30

-0,71

ИК

4,4

31

0,5

ИК

4,4

32

0,4

ИК

4,4

33

1,25

ИК

4,2

34

-0,93

ИК

4,2

35

-0,1

ИК

4,0

36

-0,9

ИК

3,9

37

2,2

ИК

3,9

38

-0,48

РТМ

3,9

39

0,7

3,8

40

-0,86

ИК

3,8

41

1,15

РТМ

3,8

42

0,8

3,8

43

-0,39

РТМ

3,8

44

1,05

РТМ

3,7

45

-0,62

ИК

3,6

46

2,2

ИК

3,5

47

-0,8

ИК

3,4

48

2,44

ИК

3,4

49

0,34

РТМ

3,3

50

1,3

ИК

3,3

51

1,87

РТМ

3,3

52

0,5

3,1

53

0,9

ИК

3,1

54

0,8

3,0

55

-1,3

ИК

2,9

56

-0,31

ИК

2,8

57

0,85

РТМ

2,8

58

0,34

ИК

2,7

59

-1,28

ИК

2,4

60

1,14

ИК

2,3

61

0,61

РТМ

2,3

62

-0,66

РТМ

2,3

63

-1,3

ИК

2,3

64

-0,31

РТМ

2,2

65

-0,65

РТМ

2,2

66

0,57

ИК

2,1

67

2,7

ИК

2,1

При использовании данного алгоритма важнейшим шагом является определение "критерия классификации", по которому будет происходить распределение молочной железы в тот или иной класс. Рассмотрим алгоритм поиска критерия классификации. Вначале определим множество значений Sj, по определенной выше формуле

,

где j - номер молочной железы (в нашем случае n=67).

Для того чтобы найти S0, вначале найдем "значимые" интервалы области изменений для каждого класса. Чтобы разбить на интервалы, был выполнен следующий алгоритм:

1. Находим подобласти , где sl определяется по формуле:

2. Если значение больше значения sl, то относим молочную железу к классу "Больные", иначе к классу "Здоровые".

3. Если проверены все молочные железы, то находим специфичность (доля верно диагностированных здоровых):

где m - количество молочных желез класса "Здоровые", правильно классифицированных, M - общее количество молочных желез класса "Здоровые"

и чувствительность (доля позитивных результатов теста в группе больных пациенток):

где n - количество молочных желез класса "Больные", правильно классифицированных, N - общее количество молочных желез класса "Больные".

4. Каждой подобласти ставится в соответствие число

5. Находим максимум среди :

который достигается на множестве .

6. Выбираем критерий классификации .

В результате работы алгоритма, был найден критерий классификации .

Найденные алгоритмы проверялись на обучающей выборке из 550 молочных желез (80 молочных желез пациенток здоровых и 470 молочных желез пациенток с заболеваниями молочных желез). При проверке была достигнута точность - 89,5%, специфичность - 75% и чувствительность - 91,9%.

7.2. Минимизация набора высокоинформативных признаков для первого алгоритма

Получив критерий диагностики, стоит отметить, что точность диагностики здоровых пациенток (специфичность) оставляет желать лучшего. Одной из причин последнего является недостаточно оптимальный выбор используемых диагностических признаков. Было решено, с помощью вычислительных экспериментов произвести поиск более эффективного набора признаков.

При использовании первоначального набора высокоинформативных признаков с выбранным критерием классификации, в результате диагностики была достигнута точность в 89,5%, специфичность- 75%, чувствительность - 91,9%.

Минимизация набора происходила следующим образом:

Шаг 1. Берем два высокоинформативных признака.

Шаг 2. Проводим по выбранным признакам диагностику.

Шаг 3. Фиксируем специфичность и чувствительность , полученные в результате диагностики. Вычисляем .

Шаг 4. К выбранным признакам добавляем следующий по информативности признак.

Шаг 5. Проводим диагностику.

Шаг 6. Фиксируем специфичность и чувствительность . Вычисляем .

Шаг 7. Если , то признак остается в наборе, иначе признак исключается.

Шаг 8. Повторяются шаги с 4-7.

В результате применения указанного выше алгоритма был получен следующий набор признаков.

Таблица 16 - Признаки для алгоритма классификации

Признак

Диапазон измерения

Комбинированная информативность

1

-0,75

РТМ

12,2

2

-0,55

РТМ

10,3

3

0,9

9,8

4

1,2

РТМ

9,7

5

-0,75

РТМ

9,0

6

1,3

РТМ

9,0

7

0,41

РТМ

8,5

8

-0,6

РТМ

8,5

9

-0,95

РТМ

8,3

10

0,69

РТМ

7,1

11

1

6,1

12

0,36

ИК

6,1

13

0,86

ИК

6,0

14

0,9

ИК

5,9

15

-0,65

ИК

5,3

16

-0,71

ИК

4,4

17

1,25

ИК

4,2

18

0,7

3,8

19

0,8

3,8

20

-0,39

РТМ

3,8

21

-0,62

ИК

3,6

Затем, с помощью алгоритма описанного в предыдущем параграфе, был найден новый критерий . Таким образом, при выполнении неравенства молочная железа будет относиться к классу "Больные", в противном случае - к классу "Здоровые".

При проверке на обучающей выборке из 550 молочных желез пациенток (80 молочных желез здоровых пациенток и 470 молочных желез пациенток с заболеваниями молочных желез) на основе 21 признака, была достигнута точность - 90,9%, специфичность - 85% и чувствительность - 91,9%.

7.3 Проверка алгоритма диагностики на тестовых выборках

Алгоритм с использованием минимизированного набора признаков был проверен на тестовых выборках.

В связи с малым количеством данных выборка была поделена на обучающую и тестовую (тестовая выборка 1) случайным образом. Выборка была разделена следующим образом: в обучающую выборку были включены молочные железы двух классов: молочные железы здоровых пациенток (40 молочных желез) и молочные железы больных пациенток (234 молочных железы). В тестовую выборку 1 отнесли молочные железы, которые не были включены в обучающую.

Тестовую выборку 1 составляют молочные железы двух классов: здоровые молочные железы здоровых пациенток (40 молочных желез) и молочных желез больных пациенток (236 молочных желез).

Для признаков из минимизированного набора были рассчитаны новые интервалы и, соответствующие им, информативности при помощи алгоритма диагностики, описанного в параграфе 7.1.

В результате был получен следующий набор признаков.

Таблица 17 - Признаки для алгоритма классификации

Признак

Диапазон измерения

Комбинированная информативность

1

-0,88

РТМ

9,8

2

1,1

РТМ

8,4

3

1

7,8

4

2,1

5,9

5

1,2

РТМ

5,9

6

-0,65

ИК

5,3

7

1,8

4,6

8

1,9

4,5

9

1,05

РТМ

4,1

10

2,2

ИК

4,0

11

0,44

РТМ

3,9

12

0,55

ИК

3,8

13

0,71

РТМ

3,2

14

0,8

РТМ

3,1

15

0,48

ИК

3,1

16

-0,75

ИК

3,0

17

-0,5

РТМ

2,6

18

-0,66

ИК

2,6

19

-0,19

РТМ

2,5

20

-0,55

РТМ

2,4

21

0,75

РТМ

2,4

22

0,32

РТМ

2,3

23

-0,5

РТМ

2,2

Также был найден новый критерий .

В результате диагностики на тестовой выборке 1 была получена точность 87,6%, специфичность - 85% и чувствительность 88%.

Ближе к концу исследования была получена база данных больных пациенток. В результате анализа была сформирована независимая тестовая выборка (тестовая выборка 2). Она включает в себя информацию о 1148 молочных железах больных пациенток. Данные тестовой выборки 2 делятся в соответствии с преобладанием того или иного нарушения следующим образом:

· данные здоровых молочных желез больных пациенток (51 молочных желез);

· данные молочных желез с наличием раковой опухоли (98 молочных желез);

· данные молочных желез с наличием фиброзно-кистозной мастопатии (937 молочных желез);

· данные молочных желез с наличием прочих нарушений таких, как гинекомастия, фиброаденома, мастит (62 молочных желез).

В результате диагностики на независимой тестовой выборке 2 была получена чувствительность 91,5%.

Заключение

Подводя итоги, стоит отметить, что все поставленные цели и задачи были достигнуты. При этом в данной тематике есть еще много материала для дальнейших исследований.

В данной работе было проверено около 100 закономерностей. Были выделены характерные закономерности поведения температурных полей различных групп пациенток, которые были сформированы в признаки.

Одним из немаловажных результатов работы является тщательный анализ влияния различных факторов, таких как возраст пациента и количество беременностей и родов, на результаты измерений комбинированной термометрии, позволивший в процессе исследования сформировать обучающую и тестовую выборки. Данные результаты описаны в статье, которая принята к публикации [5].

Основными результатами работы является:

· разработанный алгоритм поиска высокоинформативных признаков по данным комбинированной термометрии;

· разработанный алгоритм поиска характеристических признаков по данным комбинированной термометрии;

· разработанные и реализованные алгоритмы диагностики пациенток, на основе найденных признаков.

Впервые был разработан алгоритм на основе совокупности высокоинформативных и характеристических признаков.

Разработанные алгоритмы предварительно прошли проверку на тестовых выборках.

Результаты проверки приведены ниже (см. Таблица 18).

Таблица 18 - Результаты проверки

Точность

Точность диагностики здоровых (специфичность)

Точность диагностики больных (чувствительность)

Обучающая выборка

90,9%

85%

91,9%

Тестовая выборка 1

87,6%

85%

88%

Тестовая выборка 2

91,5%

Полученные данные на основе методики дают результат, приемлемый для использования в интеллектуальном аппаратно-программном комплексе диагностики заболевания молочных желез.

Список литературы

1. Бурдина Л.М. Применение радиотермометра диагностического компьютеризированного интегральной глубинной температуры ткани для диагностики рака молочной железы / Бурдина Л.М., Хайленко В.А., Кижаев Е.В. и др. // Пособие для врачей. - М. - 1999 г. - С. 35

2. Вайсблат А.В. Использование микроволновой радиотермометрии в диагностике рака молочной железы / Вайсблат А.В., Веснин С.Г., Конкин М.А. и др. [сайт]. URL: http://www.resltd.ru/rus/literature/cancer.htm

3. Воронцов К.В. Лекции по логическим алгоритмам классификации: курс лекций // MachineLearning.RU. 2007. URL:

http://www.ccas.ru/voron/download/LogicAlgs.pdf

4. Гмурман В.Е. Теория вероятностей и математическая статистика: Учебное пособие для вузов. -- 10-е издание, стереотипное. -- Москва: Высшая школа, 2004. -- 479 с.

5. Замечник Т.В. К вопросу об оптимизации скринингового обследования молочных желез методом микроволновой радиотермометрии / Замечник Т.В., Мазепа Е.А., Черкесова С.И. и др. // Вестник новых медицинских технологий, 2014. [В печати]

6. Маммология: национальное руководство/ под ред. В.П. Харченко, Н.И. Рожковой. - М.: ГЕОТАР-Медиа, 2009. - 328с.

7. Медик В.А. Математическая статистика в медицине: учебное пособие / В.А. Медик, М.С. Токмачев. - М.: Финансы и статистика, 2007. - 800 с.

8. Методы диагностики и обследования [сайт]. URL: http://www.analyz-in-moscow.ru/analizy_v_mammologii/

9. Моисеенко В.М. Кинетические особенности роста рака молочной железы и их значение для раннего выявления опухоли / Моисеенко В.М., Семиглазов В.Ф. - Маммология, №3, 1997. с. 3-11.

10. О внесении изменений в постановление Правительства Москвы от 4 октября 2011 г. №461-ПП: Постановление Правительства Москвы от 14 мая 2014 г. №249-ПП. URL:

http://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70554486/#review

11. Рожкова Н.И. Факторы, влияющие на эффективность радиотермометрических измерений молочной железы с помощью диагностического комплекса РТМ-01-РЭС / Рожкова Н.И., Смирнова Н.А., Назаров А.А.// "Опухоли женской репродуктивной системы" №3, 2007, с. 21-25

12. Тихомирова Н.Н. Микроволновая радиотермометрия. Техника проведения РТМ-обследования молочных желез. 2008. - 64с.

13. Черкесова С.И., Математические модели классификации в диагностике рака молочной железы // Материалы Научной сессии, часть 1, г. Волгоград, 2014 г. - Волгоград: Издательство ВолГУ, 2014. - с. 379.

Приложение

Таблица 1. Высокоинформативные признаки.

Признак

Диапазон измерения

Доля молочных желез класса "Здоровые", у которых наблюдается признак

Доля молочных желез класса "Больные", у которых наблюдается признак

Комбинированная информативность

1

-0,75

РТМ

1

15

12,2

2

-0,55

РТМ

3

24

10,3

3

0,9

3

23

9,8

4

1,2

РТМ

1

12

9,7

5

-0,75

РТМ

2

17

9,0

6

1,3

РТМ

2

17

9,0

7

0,41

РТМ

8

36

8,5

8

-0,6

РТМ

2

16

8,5

9

-0,95

РТМ

2

16

8,3

10

0,67

РТМ

2

15

7,7

11

1,1

РТМ

1

10

7,7

12

0,69

РТМ

1

9

7,1

13

-0,4

РТМ

4

21

7,0

14

1

1

8

6,1

15

0,36

ИК

4

19

6,1

16

0,86

ИК

8

28

6,0

17

0,69

РТМ

2

12

5,9

18

0,9

ИК

15

41

5,9

19

-0,9

РТМ

2

11

5,5

20

0,7

1

7

5,5

21

0,63

ИК

8

26

5,4

22

0,9

ИК

7

24

5,4

23

-0,65

ИК

13

35

5,3

24

1,3

РТМ

2

11

5,3

25

-0,5

РТМ

9

27

5,1

26

1,05

РТМ

6

20

5,0

27

0,9

ИК

21

46

4,8

28

-0,34

РТМ

9

25

4,6

29

-0,65

РТМ

4

15

4,5

30

-0,71

ИК

3

12

4,4

31

0,5

ИК

2

9

4,4

32

0,4

ИК

17

37

4,4

33

1,25

ИК

2

9

4,2

34

-0,93

ИК

2

9

4,2

35

-0,1

ИК

4

14

4,0

36

-0,9

ИК

7

19

3,9

37

2,2

ИК

1

5

3,9

38

-0,48

РТМ

2

8

3,9

39

0,85

1

5

3,8

40

0,7

1

5

3,8

41

-0,86

ИК

1

5

3,8

42

1,15

РТМ

3

11

3,8

43

0,8

2

8

3,8

44

-0,39

РТМ

12

27

3,8

45

1,05

РТМ

2

8

3,7

46

1

1

5

3,7

47

0,85

1

5

3,7

48

-0,59

РТМ

2

8

3,7

49

-0,62

ИК

12

26

3,6

50

2,2

ИК

4

12

3,5

51

-0,8

ИК

4

12

3,4

52

2,44

ИК

4

12

3,4

53

0,34

РТМ

7

17

3,3

54

1,3

ИК

2

7

3,3

55

1,87

РТМ

2

7

3,3

56

1,1

10

22

3,2

57

1

1

4

3,1

58

0,7

1

4

3,1

59

0,5

1

4

3,1

60

0,9

ИК

6

14

3,1

61

0,8

6

14

3,0

62

-1,3

ИК

1

4

2,9

63

-0,31

ИК

3

8

2,8

64

0,85

РТМ

6

13

2,8

65

0,34

ИК

3

8

2,7

66

1,1

3

8

2,7

67

-1,28

ИК

2

5

2,4

68

1,14

ИК

1

3

2,3

69

0,61

РТМ

4

9

2,3

70

-0,66

РТМ

2

5

2,3

71

-1,3

ИК

1

3

2,3

72

1,2

3

7

2,2

73

-0,31

РТМ

3

7

2,2

74

-0,65

РТМ

3

7

2,2

75

0,8

1

3

2,2

76

0,57

ИК

1

3

2,1

77

2,7

ИК

1

3

2,1

Таблица 2. Характеристические признаки.

Признак

Диапазон

Количество молочных желез класса "Здоровые", у которых наблюдается признак

Количество молочных желез класса "Больные", у которых наблюдается признак

1

-1,05

РТМ

0

47

2

-1,15

РТМ

0

33

3

-1,25

РТМ

0

29

4

-1,8

РТМ

0

7

5

-0,9

РТМ

0

31

6

-1,25

РТМ

0

17

7

-1,3

РТМ

0

24

8

0,6

0

8

9

0,8

0

16

10

0,8

0

13

11

1

0

14

12

1

0

15

13

0,8

0

13

14

0,7

0

9

15

0,25

0

11

16

0,25

0

9

17

0,3

0

8

18

0,6

0

20

19

0,65

0

12

20

0,45

0

8

21

0,45

0

15

22

0,7

0

68

23

0,4

0

14

24

0,3

0

14

25

0,4

0

10

26

0,4

0

8

27

0,2

0

8

28

0,2

0

7

29

1,65

РТМ

0

14

30

1,25

РТМ

0

24

31

1,45

РТМ

0

15

32

1,7

РТМ

0

21

33

1,6

РТМ

0

48

34

1,65

РТМ

0

39

35

1,9

РТМ

0

12

36

3,7

0

2

37

4

0

1

39

3,1

РТМ

0

7

40

5,24

ИК

0

25

41

0,94

ИК

0

13

42

2,05

ИК

0

7

43

1,9

ИК

0

9

44

1,6

ИК

0

17

45

2,7

ИК

0

12

46

2,5

ИК

0

21

47

1,28

РТМ

0

16

48

0,71

РТМ

0

9

49

0,57

РТМ

0

11

50

0,69

РТМ

0

9

51

0,89

РТМ

0

24

52

1,3

ИК

0

14

53

-1,42

РТМ

0

26

54

-0,69

РТМ

0

24

55

-0,89

РТМ

0

14

56

-0,91

РТМ

0

6

57

-0,69

РТМ

0

5

58

-1,22

ИК

0

17

59

-1,26

ИК

0

6

60

-0,4

ИК

0

23

61

-1,4

ИК

0

7

62

-0,67

РТМ

0

13

63

-1,02

ИК

0

15

64

0,787

РТМ

0

27

65

0,27

РТМ

0

3

66

-1,7

РТМ

0

14

67

-1,3

РТМ

0

4

68

2,3

РТМ

0

18

69

2,3

РТМ

0

13

70

2,1

РТМ

0

8

71

1,5

РТМ

0

13

72

1,7

РТМ

0

14

73

2,2

РТМ

0

17

74

2,3

РТМ

0

18

75

2,5

ИК

0

9

76

2,1

ИК

0

10

77

2,1

ИК

0

5

78

2,8

ИК

0

13

79

2,5

ИК

0

17

80

-1,8

ИК

0

11

81

-1,4

ИК

0

17

82

-1,4

ИК

0

16

83

-1,6

ИК

0

7

84

-1,1

ИК

0

12

Размещено на Allbest.ru


Подобные документы

  • Причины развития рака молочных желез. Локализация онкопатологии в молочной железе. Группы риска, симптомы и лечение. Роль акушерки в профилактике рака молочной железы. Ранняя диагностика. Система мероприятий по раннему выявлению данного заболевания.

    дипломная работа [1,9 M], добавлен 10.11.2015

  • Факторы риска развития рака молочной железы (РМЖ). Порядок осмотра и пальпации молочных желез. Дифференциальная диагностика между доброкачественной опухолью молочной железы и РМЖ. Методы лечения данного заболевания, условия назначения лучевой терапии.

    презентация [6,2 M], добавлен 20.09.2016

  • Проблема раковых заболеваний. Причины развития, группы риска, стадии, симптомы, лечение рака молочных желез. Деятельность и роль медицинской сестры в профилактике и раннем выявлении патологии молочных желез. Локализация онкопатологии в молочной железе.

    курсовая работа [1,4 M], добавлен 18.11.2017

  • Структура онкологической заболеваемости женского населения. Особенности раковой опухоли. Современные методы диагностики РМЖ. Виды рака молочной железы, симптомы. Риск развития рецидива. Эффективность лучевой терапии рака молочных желез (менее сантиметра).

    реферат [20,0 K], добавлен 30.05.2013

  • Изучение особенностей психологических реакций на наличие онкологического заболевания и способы его лечения. Определение основных проблем пациенток с раком молочной железы. Рекомендации по организации ухода за пациентками с раком молочной железы.

    презентация [1,1 M], добавлен 13.12.2017

  • Заболевания молочных желез – распространенная группа заболеваний среди женского населения. Они бывают доброкачественные и злокачественные, то есть онкологические. Медицинские исследования молочной железы, помогающие поставить или опровергнуть диагноз.

    реферат [30,1 K], добавлен 06.07.2010

  • Роль медицинской сестры в осуществлении первичной профилактике рака молочной железы. Перспективы комбинированного лечения злокачественных заболеваний. Пути профилактики, ранней диагностики и сохранения груди. Локализация онкопатологии в молочной железе.

    курсовая работа [47,5 K], добавлен 05.04.2017

  • Патогенез и классификация рака молочной железы. Факторы риска его развития. Цитологические особенности отдельных форм рака молочной железы. Особенности, присущие протоковому раку. Заболеваемость рака молочной железы в Гомельской области и Беларуси.

    дипломная работа [2,8 M], добавлен 20.09.2012

  • Факторы риска, цитологическая диагностика рака молочной железы. Критерии злокачественности рака молочной железы. Интраоперационная цитологическая диагностика рака молочной железы. Аспекты дифференциальной цитологической диагностики рака молочной железы.

    реферат [27,6 K], добавлен 05.11.2010

  • Структура онкологической заболеваемости женского населения, факторы риска рака молочной железы. Эндокринные и метаболические факторы, связанные с сопутствующими заболеваниями. Проведение цитологической и гистологической диагностики рака молочной железы.

    презентация [3,6 M], добавлен 25.10.2016

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.