Молекулярно-генетические методы исследования и дифференциальная диагностика туберкулеза
Роль метода полимеразно-цепной реакции в дифференциальной диагностике различных заболеваний органов дыхания. Молекулярно-генетическое исследование для определения устойчивости комплекса Mycobacterium tuberculosis к противотуберкулезным препаратам.
Рубрика | Медицина |
Вид | дипломная работа |
Язык | русский |
Дата добавления | 13.06.2013 |
Размер файла | 1,3 M |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Для исследования были отобрано:
- 46 проб для ПЦР исследования культур взятых с плотных и жидких (BACTEС MGIT 960 )питательных сред.
Рис. 4 - Видовая идентификация МБТ
Данная диаграмма показывает, что метод ПЦР дает точно определить видовую принадлежность микобактерий выделенных на плотных питательных средах и методом исследования с помощью BACTEC MGIT 960.
3.2 Продолжительность молекулярно-генетического метода исследования
Для исследования были отобрано:
- 46 проб для ПЦР исследования культур взятых с плотных и жидких (BACTEС MGIT 960 )питательных сред.
Таблица 2 - Продолжительность исследования ПЦР.
ПЦР n=46 |
BACTEC MGIT 960 n=19 |
P |
||
Средняя продолжительность одного исследования |
6±1 часов |
16± 2,5 дней |
<0,001 |
Данная таблица показывает, что микробиологическое исследование с использованием BACTEC MGIT 960 существенно уступает по времени проведения молекулярно-генетическому методу исследования (p<0,001).
3.3 Определение лекарственной чувствительности к противотуберкулезным препаратам
Для исследования были отобрано:
- 30 проб для определения лекарственной чувствительности одних и тех же пациентов по данным ПЦР и BACTEC MGIT 960
Таблица 3 - Сравнение результатов, полученных молекулярно-генетическим методом исследование и на системе BACTEC MGIT 960
ПТП |
Коли-чество иссле-дований |
ПЦР |
BACTEC MGIT 960 |
Совпадения |
|||
Чувст-вительны |
Резистентны |
Чувст-вительны |
Резистентны |
||||
Изониазид |
30 |
5 |
25 |
6 |
24 |
28 (93 %) |
|
Стрептомицин |
30 |
6 |
22 |
8 |
20 |
26 (86%) |
|
Рифампицин |
30 |
6 |
24 |
8 |
22 |
26 (86%) |
|
Этамбутол |
30 |
8 |
20 |
9 |
19 |
28 (93%) |
Рис. 4 - Результаты определения лекарственной чувствительности методом ПЦР
Рис. 5 - Результаты определения лекарственной чувствительности на BACTEC MGIT 960
Примечание: I- изониазид; S- стрептомицин; R- рифампицин; E- этамбутол.
Таблица 4. - Сравнительная характеристика определения лекарственной чувствительности Методом ПЦР с международным стандартом
ПТП |
Совпадения результатов ПЦР и BACTEC MGIT 960 |
Международный стандарт |
|
Изониазид |
28 (93 %) |
86-100% |
|
Стрептомицин |
26 (86%) |
82-100% |
|
Рифампицин |
26 (86%) |
79-98% |
|
Этамбутол |
28 (93%) |
82-93% |
Международный стандарт является индикатором качества определения лекарственной устойчивости МБТ методом ПЦР. Исходя из данных, приведенных выше, можно сделать вывод, что DNA-STRIP метод можно использовать в качестве диагностического теста на чувствительность МБТ к ПТП, поскольку его результаты являются весьма достоверными.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Проанализировав данные, приведенные выше в результатах собственных исследований, можно сделать следующие выводы:
При микробиологическом исследовании мокроты от больных с подозрением на туберкулез легких период тестирования образца методом ПЦР занимает значительно меньше времени, чем на автоматизированной системе BACTEC MGIT 960 ( в среднем 6 часов вместо 16 дней).
DNA-STRIP метод позволяет довольно в короткие сроки и точно определить видовую принадлежность микобактерий после положительных результатов на плотных и жидких питательных средах. Так мы получили из 46 положительных проб взятых с плотных и жидких питательных сред и выявили 21 МБТ и 25 НТМБ. Из этого мы делаем вывод что данный метод играет большую роль в диагностике и дифференциальной диагностике туберкулеза легких.
Современные бактериологические способы определения чувствительности микобактерий к противотуберкулезным препаратам Молекулярно-генетическим методом дают возможность получить результаты, хорошо сопоставимые с автоматизированной системой BACTEC MGIT 960. Согласованность данных наблюдалась для изониазида (93%), рифампицина (85%), стрептомицина (87%) и для этамбутола (93%). Высокая степень совпадения двух методов по определению лекарственной чувствительности микобактерий к препаратам первого ряда позволяет рассматривать их как взаимозаменяемые и отдавать предпочтение молекулярно-генетическому методу как более объективному, стандартизованному и ускоренному.
Сравнение эффективности использования молекулярно-генетического метода для выявления возбудителя туберкулеза , дифференциальной диагностике туберкулеза легких и определения лекарственной чувствительности МБТ с традиционными методами на плотных средах и автоматизированном методе ВАСТЕС 960 демонстрирует более высокие диагностические качества. Однако DNA-STRIP метод также имеет свои недостатки и не может полностью заменить собой применение плотных и жидких питательных сред . Метод необходим для составления ориентировочного плана лечения больного с учетом лекарственной чувствительности МБТ к противотуберкулезным препаратам. Поэтому более целесообразно его использование в качестве дополнительного метода в диагностике туберкулеза наряду с традиционными и другими автоматизированными методами.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Щербо, С.Н. ПЦР в клинической лабораторной диагностике: реальности и перспективы/ С.Н. Щербо - Москва: 2006. - 48с.
Тарасенко, И.М. Правила организации работы КДЛ с патогенными биологическими агентами/ И.М. Тарасенко; под ред. Анищенко Д.П. - Москва: 2007. - 40 с.
Херсонская А.М. Современные методы клинической диагностики: ПЦР в режиме реального времени/ А.М.Херсонская - Саратов: 2008. - 36с.
Чухловин.А.Б. Метод ПЦР в клинической лабораторной диагностике/ А.Б.Чухлобин - Москва 2008. - 50 с.
Кошечкин, В.А.Туберкулез/ В.А. Кошечкин, З.А. Иванова - Москва: 2007. - 243 с.
Park, H. Comparison of a conventional antimicrobial susceptibility assay to an oligonucleotide chip system for detection of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis isolates/ Н. Park. E. Song: 2006 - 44 p.
Perkins, MD Progress towards improved tuberculosis diagnostics for developing countries. Lancet/ Perkins, MD: 2006 - 232p.
Perkins, MD. PCR-based diagnostics for infectious diseases: uses, limitations, and future applications in acute-care settings. Int J Tuberc Lung Dis./ Perkins MD, Small PM: 2006 - 10 p.
Piersimoni, C. Current perspectives on drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis complex: the automated nonradiometric systems. J Clin Microbiol 2006; 44: 20-8.
Pfyffer GE. Laboratory diagnosis of tuberculosis. In: Kaufmann SHE, Hahn H, eds. Mycobacteria and TB. Basel/ C. Piersimoni,A. Olivieri, L. Benacchio, C. Scarparo - Switzerland: 2003. pp. 67-68.
Ramazanzadeh, R, Comparison between molecular epidemiology, geographical regions and drug resistance in Mycobacterium tuberculosis strains isolated from European patients. Chemotherapy/ R, Ramazanzadeh. P. Farnia: 2006. pp 42-43.
Черноусова Л. Н. Современные тенденции и способности микробиологической диагностики туберкулеза/ Л.Н Черноусова - Москва: 2009. - 96с.
Reed MB. Strain identification of Myco-bacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology / Reed MB, P. Domenech, C. Manca 2004. - 59p.
Savelkoul PH. Detection of Mycobacterium tuberculosis complex with Real Time PCR: comparison of different primer-probe sets based on the IS6110 element. J Microbiol Methods/ Savelkoul PH, A. Catsburg,S. Mulder - 2006. - 80 p.
Ларионова, Е.Е. Информативность полимеразной цепной реакции для диагностики туберкулеза легких: автореф. дис. к.б.н. 03.00.07/ Е.Е.Ларионова; Рос.акад.мед. наук - Москва, 2005. - 21 с.
Размещено на Allbest.ru
Подобные документы
Методы диагностики туберкулеза легких. Роль метода полимеразно-цепной реакции в дифференциальной диагностике различных заболеваний органов дыхания. Молекулярно-генетическое исследование для идентификации видов микобактерий из культурального материала.
дипломная работа [532,6 K], добавлен 28.05.2013Осуществление рутинных методик полимеразно-цепной реакции (ПЦР). ПЦР диагностика туберкулеза легких. Молекулярно-генетическое исследование для идентификации видов микобактерий из культурального материала. ПЦР диагностика внелегочных форм туберкулеза.
курсовая работа [1,2 M], добавлен 20.05.2013Современная диагностика туберкулеза. Принцип работы автоматизированной системы Bactec Mgit 960 для выявления микобактерий туберкулеза и постановки тестов на лекарственную чувствительность к противотуберкулезным препаратам. Материалы и методы исследования.
дипломная работа [118,6 K], добавлен 19.05.2013Сущность, значение и области применения молекулярно-генетических методов исследования. Специфика метода полимеразной цепной реакции. Блот-гибридизация по Саузерну. Картирование генов и идентификация хромосомных аберраций с помощью "FISH"-метода.
презентация [971,4 K], добавлен 07.12.2014Рассмотрение многообразия клинических проявлений и форм туберкулеза. Этапы диагностики туберкулеза, правила сбора мокроты, рентгенологические проявления туберкулеза органов дыхания. Культуральные и молекулярно-генетические методы выявления возбудителя.
презентация [933,0 K], добавлен 13.04.2015Причины заражения корью и краснухой. Симптомы заболеваний у детей. Диагностика, профилактика и лечение вирусных инфекций. Молекулярно-генетические, иммунохимические и вирусологические методы исследования. Иммунитет после перенесенных заболеваний.
презентация [1,4 M], добавлен 25.04.2015Сущность и принципы метода полимеразной цепной реакции, его достоинства и недостатки. Метод молекулярных колоний. Онкомаркеры в клинической диагностике. Муциноподобный ассоциированный антиген в сыворотке. Алгоритм и методика исследования на онкомаркеры.
курсовая работа [59,6 K], добавлен 19.11.2014Роль наследственных факторов в возникновении и развитии туберкулеза. Молекулярные механизмы патогенеза туберкулеза у человека. Физиологические функции белковых продуктов генов-кандидатов. Молекулярно–генетические методы анализа полиморфизма генов.
дипломная работа [851,1 K], добавлен 11.08.2010Возможности современных методов лучевой диагностики в распознании туберкулеза легких. Трудности в дифференциальной диагностике ТБ, хронических неспецифических заболеваний легких (ХНЗЛ), новообразований, туберкулезных и карциноматозных плевритов.
реферат [64,3 K], добавлен 04.12.2016История открытия метода полимеразной цепной реакции (ПЦР), его особенности и этапы. Методика проведения анализа в режиме реального времени. Преимущества применения метода ПЦР в диагностике инфекционных заболеваний, его ограничения и сферы использования.
реферат [685,7 K], добавлен 03.05.2013